Columns data type field definition

---

PDB File ­ Atom Record Format

*

COLUMNS        DATA  TYPE    FIELD        DEFINITION

­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­­

 1 ­  6        Record name   "ATOM  "

 7 ­ 11        Integer       serial       Atom  serial number.

13 ­ 16        Atom          name         Atom name.

17             Character     altLoc       Alternate location indicator.

18 ­ 20        Residue name  resName      Residue name.

22             Character     chainID      Chain identifier.

23 ­ 26        Integer       resSeq       Residue sequence number.

27             AChar         iCode        Code for insertion of residues.

31 ­ 38        Real(8.3)     x            Orthogonal coordinates for X in Angstroms.

39 ­ 46        Real(8.3)     y            Orthogonal coordinates for Y in Angstroms.

47 ­ 54        Real(8.3)     z            Orthogonal coordinates for Z in Angstroms.

55 ­ 60        Real(6.2)     occupancy    Occupancy.

61 ­ 66        Real(6.2)     tempFactor   Temperature  factor.

77 ­ 78        LString(2)    element      Element symbol, right­justified.

79 ­ 80        LString(2)    charge       Charge  on the atom.

         1         2         3         4         5         6         7         8

12345678901234567890123456789012345678901234567890123456789012345678901234567890

ATOM     32  N  AARG A  ­3      11.281  86.699  94.383  0.50 35.88           N  

ATOM     33  N  BARG A  ­3      11.296  86.721  94.521  0.50 35.60           N

ATOM     34  CA AARG A  ­3      12.353  85.696  94.456  0.50 36.67           C

ATOM     35  CA BARG A  ­3      12.333  85.862  95.041  0.50 36.42           C

ATOM     36  C  AARG A  ­3      13.559  86.257  95.222  0.50 37.37           C

ATOM     37  C  BARG A  ­3      12.759  86.530  96.365  0.50 36.39           C

ATOM     38  O  AARG A  ­3      13.753  87.471  95.270  0.50 37.74           O

ATOM     39  O  BARG A  ­3      12.924  87.757  96.420  0.50 37.26           O

ATOM     40  CB AARG A  ­3      12.774  85.306  93.039  0.50 37.25           C

ATOM     41  CB BARG A  ­3      13.428  85.746  93.980  0.50 36.60           C

ATOM     42  CG AARG A  ­3      11.754  84.432  92.321  0.50 38.44           C

ATOM     43  CG BARG A  ­3      12.866  85.172  92.651  0.50 37.31           C

ATOM     44  CD AARG A  ­3      11.698  84.678  90.815  0.50 38.51           C

ATOM     45  CD BARG A  ­3      13.374  85.886  91.406  0.50 37.66           C

ATOM     46  NE AARG A  ­3      12.984  84.447  90.163  0.50 39.94           N

ATOM     47  NE BARG A  ­3      12.644  85.487  90.195  0.50 38.24           N

ATOM     48  CZ AARG A  ­3      13.202  84.534  88.850  0.50 40.03           C

ATOM     49  CZ BARG A  ­3      13.114  85.582  88.947  0.50 39.55           C

ATOM     50  NH1AARG A  ­3      12.218  84.840  88.007  0.50 40.76           N

ATOM     51  NH1BARG A  ­3      14.338  86.056  88.706  0.50 40.23           N

ATOM     52  NH2AARG A  ­3      14.421  84.308  88.373  0.50 40.45           N

* Adapted from http://www.wwpdb.org/documentation/format33/sect9.html