Curriculum Vitae of Giovanni Parmigiani

PUBLICATIONS

Link to Publications on Google Scholar

Griswold2004

Books

[1] Parmigiani G. Modeling in Medical Decision Making: A Bayesian Approach. Chichester: Wiley

2002.

[2] Parmigiani G, Garrett ES, Irizarry R, Zeger SL, eds. The analysis of gene expression data: an

overview of methods and software. New York: Springer 2003.

[3] Parmigiani G, Inoue LYT. Decision Theory: Principles and Approaches. Chichester: Wiley 2009.

Evidence Reports

[4] Marchionni L, Wilson RF, Marinopoulos SS, Wolff AC, Parmigiani G, Bass EB, Goodman SN. Impact

of gene expression profiling tests on breast cancer outcomes. Evid Rep Technol Assess Full Rep 1–105

Dec 2007.

Articles

[5] Banks DL, Parmigiani G.

Pre-analysis of super large industrial data sets

. Journal of Quality

Technology 24; 115–129 1992.

[6] Parmigiani G.

Minimax, information and ultrapessimism

. Theory and Decision 33; 241–252 1992.

[7] Parmigiani G.

On optimal screening ages

. Journal of the American Statistical Association 88;

622–628 1993.

[8] Muliere P, Parmigiani G, Polson NG. A note on the residual entropy function. Probability in the

Engineering and Informational Sciences 7; 413–420 1993.

[9] Muliere P, Parmigiani G. On quasi-means. Utilitas Mathematica 43; 79–87 1993.

[10] Parmigiani G.

Optimal inspection and replacement policies with age-dependent failures and fallible

tests (stma V35 3349)

. Journal of the Operational Research Society 44; 1105–1114 1993.

[11] Muliere P, Parmigiani G.

Utility and means in the 1930s

. Statistical Science 8; 421–432 1993.

[12] Parmigiani G.

Inspection times for stand-by units

. Journal of Applied Probability 31; 1015–1025

1994.

[13] M¨

uller P, Parmigiani G.

Optimal design via curve fitting of Monte Carlo experiments

. Journal of

the American Statistical Association 90; 1322–1330 1995.

[14] Parmigiani G.

Optimal scheduling of fallible inspections

. Operations Research 44; 360–367 1996.

[15] Carota C, Parmigiani G, Polson NG.

Diagnostic measures for model criticism

. Journal of the

American Statistical Association 91; 753–762 1996.

4

---

[16] Clyde MA, DeSimone H, Parmigiani G.

Prediction via orthogonalized model mixing

. Journal of

the American Statistical Association 91; 1197–1208 1996.

[17] Berry DA, Parmigiani G, Sanchez J, Schildkraut J, Winer E.

Probability of carrying a mutation

of breast-ovarian cancer gene BRCA1 based on family history

. J Natl Cancer Inst 89; 227–238

1997.

[18] Weinstein MP, Towns ML, Quartey SM, Mirrett S, Reimer LG, Parmigiani G, Reller LB.

The

clinical significance of positive blood cultures in the 1990s: a prospective comprehensive evaluation

of the microbiology, epidemiology, and outcome of bacteremia and fungemia in adults.

Clin Infect

Dis 24; 584–602 Apr 1997.

[19] Parmigiani G, Samsa GP, Ancukiewicz M, Lipscomb J, Hasselblad V, Matchar DB.

Assessing

uncertainty in cost-effectiveness analyses: application to a complex decision model.

Med Decis

Making 17; 390–401 1997.

[20] Matchar DB, Samsa GP, Matthews JR, Ancukiewicz M, Parmigiani G, Hasselblad V, Wolf PA,

D’Agostino RB, Lipscomb J.

The stroke prevention policy model: linking evidence and clinical

decisions.

Ann Intern Med 127; 704–711 Oct 1997.

[21] Dominici F, Parmigiani G, Reckhow KH, Wolpert RL.

Combining information from related regres-

sions

. Journal of Agricultural Biological and Environmental Statistics 2; 313–332 1997.

[22] Parmigiani G.

Timing medical examinations via intensity functions

. Biometrika 84; 803–816 1997.

[23] Parmigiani G, Berry D, Aguilar O.

Determining carrier probabilities for breast cancer-susceptibility

genes BRCA1 and BRCA2.

Am J Hum Genet 62; 145–158 Jan 1998. PMC1376797.

[24] Lipscomb J, Parmigiani G, Hasselblad V.

Combining expert judgment by hierarchical modeling:

An application to physician staffing

. Management Science Journal of the Institute of Management

Sciences 44; 149–161 1998.

[25] Lipscomb J, Ancukiewicz M, Parmigiani G, Hasselblad V, Samsa G, Matchar DB.

Predicting the

cost of illness: a comparison of alternative models applied to stroke.

Med Decis Making 18;

S39–S56 1998.

[26] Berry DA, Parmigiani G. Assessing the benefits of testing for breast cancer susceptibility genes:

a decision analysis. Breast Dis 10; 115–125 Apr 1998.

[27] Clyde MA, Parmigiani G.

Protein construct storage: Bayesian variable selection and prediction

with mixtures.

J Biopharm Stat 8; 431–443 Jul 1998.

[28] Petersen GM, Parmigiani G, Thomas D.

Missense mutations in disease genes: a bayesian approach

to evaluate causality.

Am J Hum Genet 62; 1516–1524 Jun 1998. PMC1377150.

[29] Carota C, Parmigiani G.

A Dirichlet process elaboration diagnostic for binomial goodness of fit

.

Test 7; 133–145 1998.

[30] Clyde MA, Parmigiani G, Vidakovic B.

Multiple shrinkage and subset selection in wavelets

.

Biometrika 85; 391–402 1998.

[31] Parmigiani G.

Designing observation times for interval censored data

. Sankhya A 60; 446–458

1998.

5

---

[32] Claus EB, Schildkraut J, Iversen ES, Berry D, Parmigiani G.

Effect of BRCA1 and BRCA2 on the

association between breast cancer risk and family history.

J Natl Cancer Inst 90; 1824–1829 Dec

1998.

[33] Samsa GP, Reutter RA, Parmigiani G, Ancukiewicz M, Abrahamse P, Lipscomb J, Matchar DB.

Performing cost-effectiveness analysis by integrating randomized trial data with a comprehensive

decision model: application to treatment of acute ischemic stroke.

J Clin Epidemiol 52; 259–271

Mar 1999.

[34] Dominici F, Parmigiani G, Wolpert RL, Hasselblad V.

Meta-analysis of migraine headache treat-

ments: Combining information from heterogeneous designs

. Journal of the American Statistical

Association 94; 16–28 1999.

[35] Parmigiani G, Berry DA, Winer EP, Tebaldi C, Iglehart JD, Prosnitz LR.

Is axillary lymph node

dissection indicated for early-stage breast cancer? a decision analysis.

J Clin Oncol 17; 1465–1473

May 1999.

[36] M¨

uller P, Parmigiani G, Schildkraut J, Tardella L.

A bayesian hierarchical approach for combining

case-control and prospective studies.

Biometrics 55; 858–866 Sep 1999.

[37] Iversen Jr ES, Parmigiani G, Berry DA, Schildkraut J.

Genetic susceptibility and survival: Appli-

cation to breast cancer

. Journal of the American Statistical Association 95; 28–42 2000.

[38] Dominici F, Parmigiani G, Clyde M.

Conjugate analysis of multivariate normal data with incom-

plete observations

. The Canadian Journal of Statistics La Revue Canadienne de Statistique 28;

533–550 2000.

[39] Dominici F, Parmigiani G. Bayesian semiparametric analysis of developmental toxicology data.

Biometrics 57; 150–157 Mar 2001.

[40] Jones JB, Song JJ, Hempen PM, Parmigiani G, Hruban RH, Kern SE.

Detection of mitochondrial

DNA mutations in pancreatic cancer offers a ”mass”-ive advantage over detection of nuclear DNA

mutations.

Cancer Res 61; 1299–1304 Feb 2001.

[41] Parmigiani G, Skates S.

Estimating the age of onset of detectable asymptomatic cancer

. Mathe-

matical and Computer Modeling 33(1273); 1347–60 2001.

[42] Bova GS, Parmigiani G, Epstein JI, Wheeler T, Mucci NR, Rubin MA.

Web-based tissue microarray

image data analysis: initial validation testing through prostate cancer gleason grading.

Hum Pathol

32; 417–427 Apr 2001.

[43] Ryu B, Jones J, Blades NJ, Parmigiani G, Hollingsworth MA, Hruban RH, Kern SE.

Relationships

and differentially expressed genes among pancreatic cancers examined by large-scale serial analysis

of gene expression.

Cancer Res 62; 819–826 Feb 2002.

[44] Wang TL, Rago C, Silliman N, Ptak J, Markowitz S, Willson JKV, Parmigiani G, Kinzler KW,

Vogelstein B, Velculescu VE.

Prevalence of somatic alterations in the colorectal cancer cell

genome.

Proc Natl Acad Sci U S A 99; 3076–3080 Mar 2002. PMC122475.

[45] Parmigiani G, Skates S, Zelen M.

Modeling and optimization in early detection programs with a

single exam.

Biometrics 58; 30–36 Mar 2002.

6

---