Microsoft Word Ksi\271\277ka abstrakt\363w doc

 
 
 
 
 
 
 
XIV
h
 International Conference on Molecular Spectroscopy, Białka Tatrzańska 2017
 
118
T9: O–2 
DFT calculations on (1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic acid 
 
Justyna Sienkiewicz-Gromiuk
1 
 
1 
Department of General and Coordination Chemistry, Maria Curie-Sklodowska University,             
M. Curie-Sklodowska Sq. 2, 20-031 Lublin, Poland, 
e-mail: [e-mail] 
 
 
Compounds containing 1,2,4-triazole moiety and ring system are widely used in chemistry, 
biology, medicine and agriculture because they exhibit a broad spectrum of biological properties 
such as antifungal, antibacterial, antimicrobial, anticancer, analgesic, antitumor, antitubercular, 
herbicidal, anticonvulsant and anti-inflamatory [1, 2]. 1,2,4,-triazole and its derivatives are used 
as  a  versatile  reagent  in  the  synthesis  of  many  heterocycles.  Furthermore,  1,2,4-triazole 
derivatives can coordinate to metal ions in different ways depending upon the donor sites of the 
ligand [3].  
 
The  molecule  of  (1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic  acid  (Fig.  1A)  consists  of  a  1,2,4-
triazole nucleus and a flexible aliphatic thioacetic (−SCH
2
COOH) chain. The determined crystal 
structure  of  (1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic  acid  (Fig.  1B)  confirms  that  three  kinds  of 
donor  atoms  are  involved  in  creating  a  network  of  intermolecular  hydrogen  bonds,  including 
N−H···O, O−H···N and N−H···S interactions whose function is to stabilize the two-dimensional 
wave-like layered supramolecular architecture existing in the solid state [4].  
 
The ground state geometric structure together with the vibrational and electronic features of 
(1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic  was  identified  using  molecular  spectroscopic  techniques 
and DFT studies. The calculations of various  molecular properties for the  optimized geometry 
such as the dipole moment, Mulliken atomic charges, frontier molecular orbital energies, global 
reactivity  descriptors, molecular electrostatic  potential (MEP) and  electrostatic  potential (ESP) 
surfaces were also performed. In order to test the effect of hydrogen bonding on the vibrational 
wavenumbers,  the  calculations  for  the  hydrogen  bonded  model  containing  the    N−H···O, 
O−H···N and N−H···S interactions similar to those existing in a crystal were also made 
 
 
Fig. 1. (A) Molecular structure of (1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic acid; 
(B) Part of the crystal structure of the acid showing the network of intermolecular hydrogen bonds. 
 
Keywords: (1H-1,2,4-triazol-3-ylsulfanyl)acetic acid; DFT computations; vibrational spectroscopy  
 
References  
[1]  Z.H. Chohan, S.H. Sumrra, M.H. Youssoufi, T.B. Hadda, Eur. J. Med. Chem. 45 (2010) 2739. 
[2]  L. Mazur, A.E. Kozioł, B. Modzelewska-Banachewicz, Acta Cryst. E60 (2004) 2244.  
[3]  Z.H. Chohan, S.H. Sumrra, J. Enzyme Inhib. Med. Chem. 25 (2010) 599. 
[4]  Y.-T. Wang, R.-S. Xin, J.-G. Wang, Z. Kristallogr. NCS 225 (2010) 751. 
 

---

 
 
 
 
 
 
 
XIV
h
 International Conference on Molecular Spectroscopy, Białka Tatrzańska 2017
 
 
119
T9: O–3 
Water tetrahedron intercalated with hydronium ion (H
3
O
+
) 
as molecular reactor producing deuterium under X-ray absorption: 
New insight 
 
Alexander Udal'tsov
1
 
 
1 
Faculty of Biology, Lomonosov Moscow State University, Vorobjovy Gory 12, 119234 Moscow, 
Russia, e-mail: [e-mail] 
 
 
Features of X-ray absorption and emission spectra of H
2
O and D
2
O have been interpreted in 
terms of polaronic exciton theory under interaction with the incident photon [1]. Further details 
of kinetic energy accumulation by polaronic exciton system depicted in Fig. 1 under Compton 
interaction, when fifteen-step of Compton wavelength (15λ
C
/2π) is required to obtain polaronic 
exciton radius providing kinetic energy 534.556 eV, and deuterium creation are reported in the 
present  work.  The  polaronic  exciton  theory  admits  to  evaluate  the  energy  levels  taking  into 
account inelastic effects for water tetrahedron intercalated with H
3
O
+
. 
 
 
Fig. 1. Plot of Larmor frequency relatively to angular frequency (ω
L 
/ω
t
) of electronic polaron coupled with 
shared proton versus the distance (r
ex,0 
– r
ex,n
)per the reduced Compton wavelength units, where r
ex,0 
= 0.385325 Å, 
and r
ex,n 
= r
ex,0 
– n λ
C
/(2π); and illustration of Larmor precession of the electronic polaron emerging due to 
electromagnetic field generated by the incident photon; spiral line shows electron pathway along the orbits, while 
transition between the orbits happens by a hopping step of n λ
C
/(2π), on the right. Proton sharing with the central 
water molecule is shown above. 
 
 
Consideration  of  the  precessing  polaronic  exciton  in  the  magnetic  field  generated  by  the 
incident  electromagnetic  wave  under  Compton  interaction  admits  to  derive  the  following 
formula  for  electromagnetic  mass  of  neutrino  (m
ν
)  via  electromagnetic  mass  of  electron  using 
Larmor precession frequency related to angular frequency of electron (ω
L
/ω
t
), which shows up a 
correlation with Compton interaction steps. 
 
 
 
 
m
ν 
=[e
2 
α
 
/(3π
2 
ε
0 
λ
C 
c
2 
)](2m
e
ef 
/m
h
ef
)   
 
 
 
 
 
 
 
 
 
(1) 
where m
h
ef
 and m
e
ef
 are respectively the effective masses of hole and electronic polarons, e and α 
are  the  elementary  charge  (e =  1.6021765×10
–19
  C)  and  fine  structure  constant,  ε
0
  and  c  are 
electric  constant  (ε
0 
=0.88541878×10
–11
  F m
–1
)  and  the  speed  of  light,  respectively.  With 
m
h
ef 
=9.51m
e
 and m
e
ef 
=0.5m
e
 assumed for condensed matter [2], where m
e
 is the electron mass, 
the calculated neutrino mass m
ν 
=3.445467×10
–37
 kg. 
 
Keywords: polaronic exciton; compton wavelength; neutrino 
 
References  
[1]  A.V. Udal'tsov, J. Mol. Liquid. (2017), submitted after revision. 
[2]  A.V. Udal'tsov, J. Mol. Struct. 1125 (2016) 522. 

---