Microsoft Word Ksi\271\277ka abstrakt\363w doc



Yüklə 20,03 Mb.
Pdf görüntüsü
səhifə159/173
tarix17.11.2018
ölçüsü20,03 Mb.
#80416
1   ...   155   156   157   158   159   160   161   162   ...   173

 
 
 
 
 
 
 
XIV
h
 International Conference on Molecular Spectroscopy, Białka Tatrzańska 2017
 
 
331
T9: P–5 
Spectroscopic (IR and UV-Vis) and molecular docking studies on              
1,1’-diethyldicarboxilat-3,3’-bis(3,4-dihydroxy)-7,7’-bisindolizine 
 
Gosav Steluta
1
, Maftei Dan
2
, Dediu Andreea
1
, and Dinica Rodica Mihaela
1
 
 

Chemistry, Physics and Environment Department, "Dunarea de Jos" University, Domneasca St. 47, 
800008 Galati, Romania, e-mail: Steluta.Gosav@ugal.ro 

Chemistry Department, "Al.I. Cuza" University, 11 Carol I Bldv. RO-700506, Iasi, Romania 
 
   In  the  present  paper,  a  bisindolizinic  compound  i.e.  1,1’-diethyldicarboxilat-3,3’-bis(3,4-
dihydroxy)-7,7’-bisindolizine  [1]  was  investigated  from  a  structural  and  a  vibrational  point  of 
view at DFT/B3LYP/6-311G(d,p) level of theory. The equilibrium geometry of the most stable 
conformer  of  the  title  molecule  was  determined.  The  complete  vibrational  assignments  of 
wavenumbers  for  the  most  stable  conformer  were  made  on  the  basis  of  potential  energy 
distribution  (PED).  The  observed  and  calculated  IR  frequencies  are  found  to  be  in  good 
agreement. 
 
UV-Vis  absorption  spectrum  was  recorded  for  1,1’-diethyldicarboxilat-3,3’-bis(3,4-
dihydroxy)-7,7’-bisindolizine in chloroform,  and the  observed absorption bands  were assigned 
to  electronic  transitions  computed  at  TD-DFT/6-31+G(d)  level  in  solution  using  PBE0  and 
CAM-B3LYP  exchange-correlation  functionals.  Solvent  effect  on  the  lowest  excited  state  of 
studied compound was modeled using the corrected Linear Response solvation (cLR) approach. 
Analysis  of  electron  density  reorganization  in  the  lowest  ππ*  excited  singlet  of  1,1’-
diethyldicarboxilat-3,3’-bis(3,4-dihydroxy)-7,7’-bisindolizine is performed. Also, the molecular 
electrostatic potential (MEP) maps in ground and excited states were used to further rationalize 
the effect of substitution on optical spectral properties. 
 
Docking  of  ligand  molecule  i.e.  1,1’-diethyldicarboxilat-3,3’-bis(3,4-dihydroxy)-7,7’-
bisindolizine,  onto  the  ATP-binding  site  (Fig.  1)  of  PI3Kα  isoform  has  performed  using 
AutoDock Vina software. The inhibition potency of ligand molecules is compared with that of a 
standard ligand [2] which has a moderate potency of PI3Kα inhibition i.e. IC50 = 23µM. 
 
 
 
Fig. 1. Molecular surface view of ligand compound docked in the active site of PI3Kα kinase. 
 
Keywords: bisindolizine; FTIR; B3LYP; TD-DFT 
 
References  
[1]  I.I. Druta, R.M. Dinica, E. Bacu, I. Humelnicu, Tetrahedron 54 (36) (1998) 10811. 
[2]  H. Park, H. Choi, S. Hong, D. Kim, D.S. Oh, S. Hong, Bioorg.&Med. Chem. Lett. 21 (2011) 2021.  
 
 


 
 
 
 
 
 
 
XIV
h
 International Conference on Molecular Spectroscopy, Białka Tatrzańska 2017
 
332
T9: P–6 
Vibrational assignment and the effect of α-methyl and ethyl 
substitutions on the Cu-O strength in bis-(3-alkylpentane-2,4-
dionato)copper(II): an experimental and DFT study 
 
Seyedabdollah Seyedkatouli
1
, Mohammad Vakili
1
, and Sayyed Faramarz Tayyari
1
 
 

Department of Chemistry, Ferdowsi University of Mashhad, Mashhad 91775-1436, Iran, 
e-mail: s.a.seyedkatouli@mail.um.ac.ir 
 
 
We subsisted methyl and Ethyl groups in α-position of copper (II) acetylacetonate, Cu(acac)
2
, see 
Fig .1. From the theoretical point of view, by considering the conformations of α substitutions, with 
respect  to  the  plane  of  the  molecule  and  each  other,  2  stable  conformers  can  be  obtained  for  each 
molecule,  Cu(3-Meacac)
2
  and  Cu(3-Etacac)
2
.  Our  calculations  in  the  gas  phase  indicate  that  the 
energy  difference  between  the  mentioned  forms  are  negligible,  about  0.01-0.07  kcal.mol
-1
.  A 
complete  assignment  of  the  observed  IR  and  Raman  band  frequencies  of  title  molecules  has  been 
done, and compared to those in bis(acetylacetonato)Cu(II) [1].  
 
 
Fig. 1. Figure The structure of bis-(3-alkylpentane-2,4-dionato)copper(II). 
 
 
Some optimized  geometrical and  topological parameters at  the  bond critical point (BCP)  of  the 
Cu-O bonds, calculated at the B3LYP/6-311G* level by Gaussian 09 and AIM 2000 softwares, and 
experimental and theoretical vibrational band frequencies related to the Cu-O bond strength for above 
complexes are shown in Table 1. According to this Table, the following trend in Cu-O bond strength 
is  concluded:  Cu(3-Etacac)
2
≥Cu(3-Meacac)

>Cu(acac)
2
.  According  to  the  pairwise  exchange  steric 
energies, calculated by NBO 5.0 program, the steric effect could be a good reason for the above trend.  
 
          Table 1: Comparing selected parameters related to the Cu-O bond strength for  title molecules.
 a
  
  
Cu(3-Etacac)
2
  Cu(3-Meacac)
2
b
 
Cu(acac)
2
b
 
R(Cu–O) 
1.914 
1.915(1.908)
 
1.925(1.921,1923) 
R(C–O) 
1.273 
1.272(1.285) 
1.270(1.268) 
R(C–C
α

1.415 
1.413(1.409)
 
1.403(1.404,1407) 
ρ (e.au
-3
)
 
 
0.0919 
0.0917 
0.0894 


(e.au
-5

 
-0.1311 
-0.1307 
-0.1256 
ν
s
 O-Cu-O 
469(468) 
469(467) 
466(450) 
ν
a
 O-Cu-O 
640(625) 
641(623)  
620(613) 
 
 
 
a
 Bond lengths are in Ǻ, the experimental values of  ν are in parentheses(in cm
-1
).
  
 
 
 
b
 The experimental values of bond lengths are in parentheses. Data from [2, 3]. 
 
Keywords: bis-(3-alkylpentane-2,4-dionato)copper(II); vibrational assignment; DFT. 
 
Acknowledgment 
This work was supported by the Ferdowsi University of Mashhad, Grant No. 42561.  
 
References  
[1]  M. Vakili, S.F. Tayyari, M. Hakimi-Tabar, A.-R. Nekoei, S. Kadkhodaei, J. Mol. Struct. 1058 (2014) 308. 
[2]  H. Golchoubian, Asian J. Chem. 20 (2008) 5834. 
[3]  lnge Robertson, Mary R. Truter, J. Chem. Soc. A (1967) 309. 



Yüklə 20,03 Mb.

Dostları ilə paylaş:
1   ...   155   156   157   158   159   160   161   162   ...   173




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©genderi.org 2022
rəhbərliyinə müraciət

    Ana səhifə