The platon crystallographic package

option details are given in  Section 2.5.2.2.
1.3.2.3 - CALC INTER
The result of a scan for short intermolecular contacts based on van der Waals radii is written 
to a .lis file. This calculation is automatically done as part of a CALC instruction. For the 
corresponding keyboard instruction and additional options see Section 2.5.2.5. 
1.3.2.4 - CALC COORDN
The result of a geometry scan about non-hydrogen and non-carbon atoms within 3.6 
Angstrom is written to a .lis file. This calculation is done automatically as part of a CALC 
instruction. For the corresponding keyboard instruction and additional options (see Sections 
2.5.2.7 and 2.5.2.8). There are two methods to do a CALC COORDN for a single atom.
1.
With a keyboard instruction: e.g. CALC COORDN cu1 4.5 . This will give both a 
listing on the graphical display and on the terminal window.
2.
Via the ORTEP  menu button 'CALC COORDN' (Section 1.4.1.6). Click on selected 
atom.
1.3.2.5 - CALC METAL
This option lists metal metal distances (by default) within 5.0 Angstrom.  This calculation is 
done automatically as part of a CALC instruction. The corresponding keyboard instruction 
CALC METAL radius (See Section 2.5.2.9) gives the option to change the maximum 
search distance (radius).
1.3.2.6 – CALC GEOM 
This is a less extensive calculation and output version of the more elaborate 'CALC INTRA' 
instruction. (See section 2.5.2.3).
1.3.2.7 - H-BOND ANALYSIS
Tables with D-H..A Bonds are generated and dispayed in the graphical window for 
hydrogen bonds satisfying the default or specified distance and angle criteria. 
1. Dist(D....A) < R(D) + R(A) + TOL1 (Default: TOL1 = 0.5 Angstrom) 
2. Dist(H....A) < R(H) + R(A) + TOL2 (Default: TOL2 = -0.12 Angstrom) 
3. Angle(D-H...A > TOL3 (Default: TOL3 = 100 Degrees) 
The three parameter (p1, p2, p3) defaults can be changed with SET PAR instructions 
(associated parameters PAR[8], PAR[9] and PAR[10]). In addition, various network 
analyses will be done. This calculation is done automatically as part of the CALC 
instruction (see also Section 2.5.2.6).
1.3.2.8 – TMA & Rigid Body Analysis
Several calculations are invoked (also part of the CALC ALL instruction) with this 
instruction: Analysis of the displacement parameters, TLS-analysis (Shomaker & Trueblood, 
1968) with an adapted and extended version of the code of Uri Shmueli, bond distance 
correction based on the TLS results and the Hirshfeld Rigid Bond test (Hirshfeld, 1978).  
Keyboard instruction: HINCL)_(CARTESIAN)_where:_-_Rmax'>CALC TMA (Rmax) (Atmin) (HINCL) (CARTESIAN) 
where: 
- Rmax (Default 25%) determines whether a detailed analysis is done. 
- Atmin the minimum number of atoms in the fragment (Default 7). 

---

- HINCL will force Anisotropic H-Atoms included in the analysis. 
Example: CALC TMA 40 5 HINCL 
Test Example [Data: anthracene.spf]:
 
 Herbstein & Kaftory (1976).
1.3.2.9 – L.S.-PLANE - Interactive calculation of least squares planes.
A click on this menu-option brings up an ORTEP drawing with clickable atoms and an 
option sub menu. The molecule can be rotated to a suitable orientation. The red sub menu 
item LsplDistEndon the right indicates that the program is ready to receive the atom names 
that will determine the least-squares plane by clicking on the corresponding atom centers. 
The sequence is ended (and the calculation initiated) by clicking in the End field. 
Plane determining atoms may be separated from those for which only the distance to the 
plane has to be calculated by clicking on the Dist field between the clicks on atoms 
determining the plane and those that do not. 
Alternatively, an instruction similar to LSPL c3 c4 c5 DIST c1 could be issued from the 
keyboard. 
Atoms are treated with unit-weight by default. Alternatives are weighting based on atomic 
weights and standard uncertainties (su). The weighting scheme may be changed using the 
(UAE)WLSPL button on the sub menu. 
1.3.2.10 – DihedAngle - Interactive calculation of dihedral angles between least 
squares planes.
A click on this menu-option brings up an ORTEP drawing with clickable atoms. The 
molecule can be rotated to a suitable orientation. The red sub menu item LsplWithEnd on 
the right indicates that the program is ready to receive the atom names that will determine 
the first least-squares plane by clicking on the corresponding atom names. This sequence is 
ended and the sequence for the second plane started by clicking in the With side-menu box. 
The second sequence is ended (and the calculation initiated) by clicking in the End field. 
Alternatively, an instruction similar to LSPL c3 c4 c5 WITH c1 c2 c6 could be issued from 
the keyboard. 
Atoms are treated by default with unit-weight. Alternatives are weighting based on atomic 
weights and standard uncertainties (s.u.) on the coordinates. The weighting scheme may be 
changed using the (UAE)WLSPL button on the side menu. 
1.3.2.11 – AngleLines -Interactive calculation of angle between two lines. 
A click on this menu-option brings up an ORTEP drawing with clickable atoms and 
applicable option side menu. The molecule can be rotated to a suitable orientation. The red 
sub menu item Angle2lines on the right indicates that the program is ready to receive the 
atom names that will determine the two lines respectively by clicking on the corresponding 
4 atom names. The result is shown at the bottom of the display.
Alternatively, an instruction similar to ANGLE c1 c2 c3 c4 could be issued from the 
keyboard. 

---