The platon crystallographic package

1.4.18.12 – VALID-CHECK Toggle
Validation Check Toggle ('On' indicated as RED). When this option is active, a validation check is 
run after every subsequent least-squares refinement cycle. The result, i.e. the number of A,B & C 
type alerts is displayed in RED on the main S-window and can be inspected in detail by browsing or 
printing of the associated listings (e.g. through 'browse-lps'). 
1.4.18.13 - CSD-Search
(to be done)
1.4.18.14 - R-PLUTO
(to be done)
1.4.18.15 - CONTOUR PATTERSON MAP
Contouring of PATTERSON map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.18.16 - CONTOUR DIFFERENCE MAP
Contouring of difference Fourier map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.18.17 - CONTOUR F(obs)-MAP
Contouring of difference Fourier map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.18.18 - CONTOUR SQUEEZE-MAP
Contouring of difference Fourier map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.18.19 – Laser PS
 
1.4.18.20 – Browse PS
 
1.4.18.21 - Laser-lps
This option list all printable files. Select the one to be sent to a laser printer by entering the 
corresponding number. Listing files are automatically converted to Postscript format, 
suitable for printing lineprinter output in A4-format. The default laser command is 'laser2x' 
which gives double sided printing on out local HP-laser. The default can be changed by 

---

setting the environment variable PSLASER. 
1.4.18.22 - Browse-lps
The listed files are converted automatically to PostScript format and inspected with a 
postscript viewer. 
 
1.4.18.23 - Browse-lis
Listing files generated by the various programs can be inspected with a text-editor by 
entering the relevant number. 
1.4.18.24 - PruneS-Tree
Obsolete branches of the S-Tree can be eliminated with this tool. 
Currenly, only pruning of the complete Compound-tree under s is implemented. 
1.4.18.25 - SKIP or ACCEPT-DEFAULT
Clicking on ACCEPT confirms the suggested default instruction or datum suggested in []. 
Clicking on SKIP will skip the currently suggested next instruction (when applicable) and move to 
the next suggested instruction. 
Currently implemented SKIP operations are implemented for ABSPSI & DELABS. In all other 
cases, clicking on SKIP will have no effect on the flow of the calculations. 
1.4.19 – S/SHELXL – SubMenu #0
1.4.19.2 - EDIT-s.ins
This toggle sets a flag for launching an editor prior to invoking the 
SHELXL refinement
calculations.
1.4.19.3 - EDIT S.RES
An editor is invoked for s.res (The latest refinement results). This option is for experienced 
use only. In genenal, editing s.ins (prior to launching SHELXL) will be more save. 
1.4.19.6 - Twin-Matrix 
Option to enter either a twin matrix or a pre-programmed twin matrix, to be include in the 
refinement. The current twin-matrix is eliminated by entering 0. 
1.4.19.8 - SinTHeta/Lambda-max
Button boxes for limiting the data set resolution during SHELXL refinement. 
Sin(Theta/Lambda)-max levels 0.54, 0.60, 0.65, 1.0 corresponding to theta-max (MoKa) 
22.5, 25.0, 27.5, max Degrees. 
1.4.19.9 – OmitOutlier Toggle
The toggle 'OmitOutlier' provides an automatic feature for the automatic generation of 
OMIT instructions: F(obs)/F(calc) differences larger than 8 sigma are registered. The 

---

corresponding reflections are omitted from subsequent refinement cycles. 
This option should not be used in the early refinement stages and with sufficient discretion 
otherwise. There should always be an explanation given for permanently omitted reflection 
data from the final refinement cycles. 
 
1.4.19.10 – SOLV-CHECK Toggle
Toggle for automatic checking for solvent accessible areas in the structure. 
1.4.19.11 - UisoMax 
Toggle for forced exclusion of atoms with Uiso > 0.25 Ang**2 from the model.   
1.4.19.15 - CONTOUR PATTERSON MAP
Contouring of PATTERSON map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.19.17 - CONTOUR F(obs)-MAP
Contouring of difference Fourier map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.19.18 - CONTOUR SQUEEZE-MAP
Contouring of difference Fourier map. 
See 
CONTOUR FOURIER MAP MENU
 
1.4.19.19 - ANIS ALL
 
1.4.19.21 - PLATON SYSTEM-S/SUB NpeakFmap
The Click position determines whether 30, 60, 90 or 120 peaks are sought in the SHELXL FMAP. 
1.4.19.22 - SHELXL-CGLS
 
1.4.19.23 - SHELXL-LS
 
1.4.19.24 - LIST-RES & SHELX-LPS
LIST RES: The current (SHELXL) s.res file contents are displayed for detailed inspection. 
The '.ins' input file to SHELXL may be edited prior to launching the actual SHELXL calculation. 
For this, the Toggle 'EDIT-SHXins' should be on (RED). 
SHELX-LPS: The current shelxl.lst listing is converted into the PostScript formatted file 
shelxl.lps and displayed using 'ghostscript'. More browsing & printing options are 
available via the SYSTEM-S Options menu. 

---

1.4.19.25 - SKIP or ACCEPT-DEFAULT
Clicking on ACCEPT confirms the suggested default instruction or datum suggested in []. 
Clicking on SKIP will skip the currently suggested next instruction (when applicable) and 
move to the next suggested instruction. Currently implemented SKIP operations are 
implemented for ABSPSI. In all other cases, clicking on SKIP will have no effect on the 
flow of the calculations. 
1.4.20 – LEPAGE – SubMenu #0
1.4.20.1 - MaxDotProd 
Maximum dot product of a coinciding direct and reciprocal lattice direction determining a 
two-fold axial direction in the lattice. For reduced cells this value should be set to 2. (default
). Higher values may indicate twin possibilities. Box options: 2,3,4,5,6 
1.4.20.2 - ExpErrorDeg 
Parameter determining whether the reported symmetry is pseudo or metrical (default = 0.3 
degree). Box values: 0.0, 0.1, 0.2, 0.3 
 
1.4.20.3 - TwoAxCrit 
Tolerance parameter determining whether a lattice direction coincides with a reciprocal 
lattice vector. (Default 0.5 degree). Box options: 12.5, 0.25, 0.50, 1.0, 2.0 Degree. 
1.4.20.4 - Max2Axis
By default, up to a maximum of 9 (pseudo)twofold axis will be considered. This number can 
be limited to 1, 3, 5, 7, 9 as a function of the click position. 
1.4.20.5 - SUPER/SUB CELL LOOP 
Super and Sub Cell Loops for the detection of metrical symmetry in sub and super lattices. 
See Santoro & Mighell (1972). 
The boxes from left to right represent transformation loops up to the minimum/maximum 
transformation determinant: 
1. 0.25 LOOP = 56 
2. 0.333 LOOP = 21 
3. 0.5 LOOP = 8 
4. 1.0 LOOP = 1 
5. 2.0 LOOP = 8 
6. 3.0 LOOP = 21 
7. 4.0 LOOP = 56 

---