Doc. Rndr. Evžen Amler, csc

Doc. RNDr. Evžen Amler, CSc. Ústav biofyziky 2. LF UK adresa: 2. LF UK, V Úvalu 84, 150 06 Praha 5 tel. [phone]  mail: [e-mail], http://bf.lf2.cuni.cz/

Výzkumné zaměření:

Biofyzika, tkáňové inženýrství

Kreditní kurzy:

Aplikovaná biomechanika Kurz je členěn do pěti kolokvií a separátních individuálních konzultací s rozdělenou tématikou, zaměřenou především na novinky a vývojové trendy: Současný stav a trendy v biomechanice, srovnávací biomechanika Biomechanika tkání, tkáňové inženýrství Biomechanika pohybového systému Biomechanika respiračního a kardiovaskulárního systému Neurobiomechanika, motorické řízení Každé kolokvium je vedeno formou řízené diskuse na tématiku úvodního referátu a studentských koreferátů.

Biofyzika Volitelný předmět, je doporučen především pro studenty, kteří v pregraduálním studiu neprošli obdobným kursem. Biofyzika tvoří spojovací článek mezi matematikou a fyzikou na straně jedné a biologickými vědami na straně druhé. Specifikou biofyzikální analýzy je skutečnost, že objektem zkoumání jsou živé systémy a výsledky analýzy jsou použity na řešení konkrétních problémů v jednotlivých lékařských oborech za použití moderní přístrojové techniky. Tématické bloky: Úvod do biofyziky, Zobrazovací metody, Krevní oběh, respirační systém a aplikace molekulární biofyziky, Bioakustika, Elektrické projevy organizmu, Bioenergetika, Ionizační záření, Optika lidského oka, biofyzika vidění, Biofyzika taktilního čití, Metodologické základy experimentu v biofyzice

Stěžejní publikace:

Lansky Z, Kubala M, Ettrich R, Kuty M, Plasek J, Teisinger J, Schoner W, Amler E. The hydrogen bond between Arg423 and Glu472 and other key residues, Asp 443, Ser477 and Pro489, are responsible for the formation and a different positioning of TNP-ATP and ATP within the nucleotide-binding site of Na+/K+-ATPase. Biochemistry (US), 2004, 43(26), 8303-8311, IF = 3.922(03) Kubala M, Obsil T, Obsilova V, Lansky Z, Amler E. Protein modeling combined with spectroscopic techniques: An attractive quick alternative to obtain structural information. Physiol. Res., 2004, 53 (Suppl. 1), S187-197, IF = 0.939(03) Krumscheid R, Ettrich R, Sovova Z, Susankova K, Lansky Z, Hofbauerova K, Linnertz H, Teisinger J, Amler E, Schoner W. The phosphatase activity of the isolated H4-H5 loop of Na+/K+-ATPase resides outside its ATP binding site. Eur. J. Biochem., 2004, 271(19), 3923-3936, IF = 3.001(03) Kubala M, Plasek J, Amler E. Fluorescence competition assay for the assessment of ATP binding to an isolated domain of Na+,K+-ATPase. Physiol. Res., 2004, 53(1), 109-113, IF = 0.939(03) Konopasek I, Vecer J, Strzalka K, Amler E. Short-lived fluorescence component of DPH reports on lipid—water interface of biological membranes. Chem. Phys. Lipids, 2004, 130(2), 135-44, IF = 1.519(03) Janata J, Hola K, Kubala M, Gakh O, Parkhomenko N, Matuskova A, Kutejova E, Amler E. Substrate evokes translocation of both domains in the mitochondrial processing peptidase alpha-subunit during which the C-terminus acts as a stabilizing element. Biochem. Biophys. Res. Commun., 2004, 316(1), 211-217, IF = 2.836(03) Lánský Z, Kubala M, Varga F, Koláčná L, Amler E. Protein structure and dynamics determined by protein modeling combined with spectroscopic techniques. Bratisl Lek Listy, 2006, 107(4), 118-22 Handl M, Amler E, Bräun K, Holzheu J, Trc T, Imhoff AB, Lytvynets A, Filová E, Kolářová H, Kotyk A, Martínek V.Positive effect of oral supplementation with glycosaminoglycans and antioxidants on the regeneration of osteochondral defects in the knee joint. Physiol Res. 2007;56(2):243-9. Epub 2006 Mar 23, IF =1.505(07) Handl M, Filova E, Kubala M, Lansky Z, Kolacna L, Vorlicek J, Trc T, Amler E. Fluorescent advanced glycation end products in the detection of factual stages of cartilage degeneration. Physiol Res. 2007; 56(2):235-42. Epub 2006 Mar 23, IF =1.505(07) Handl M, Drzik M, Cerulli G, Povysil C, Chlpik J, Varga F, Amler E, Trc T. Reconstruction of the anterior cruciate ligament: dynamic strain evaluation of the graft. Knee Surg Sports Traumatol Arthrosc. 2007 Mar;15(3):233-41, IF = 1.626(07) Kolacna L, Bakesova J, Varga F, Kostakova E, Planka L, Necas A, Lukas D, Amler E, Pelouch V. Biochemical and biophysical aspects of collagen nanostructure in the extracellular matrix. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S51-S60, IF =1.505(07) Tejral G, Kolacna L, Kotyk A, Amler E. Comparative modeling of the H4-H5-loop of the α2-isoform of Na+/K+-ATPase α-subunit in the E1 conformation. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S143-151, IF =1.505(07) Jančář J, Slovíková A, Amler E, Krupa P, Kecová H, Planka L, Gal P, Nečas A. Mechanical response of porous scaffolds for cartilage engineerIng. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S17-S26, IF =1.505(07) Varga F, Drzik M, Handl M, Chlpik J, Kos P, Filova E, Rampichova M, Necas A, Trc T, Amler E. Biomechanical characterization of cartilages by a novel approach of blunt impact testIng. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S61-S68, IF =1.505(07) Krupa P, Krsek P, Javornik M, Dostal O, Srnec R, Usvald D, Proks P, Kecova H, Amler E, Jancar J, Gal P, Planka L, Necas A. Use of 3D geometry modelling of osteochondrosis-like iatrogenic lesions as a template for press-and-fit scaffold seeded with mesenchymal stem cells. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S107-S114, IF =1.505(07) Filova E, Rampichova M, Handl M, Lytvynets A, Halouzka R, Usvald D, Hlucilova J, Prochazka R, Dezortova M, Rolencova E, Kostakova E, Trc T, Stastny E, Kolacna L, Hajek M, Motlik J, Amler E. Composite hyaluronate-type I collagen-fibrin scaffold in the therapy of osteochondral defects in miniature pigs. Physiol. Res. 2007; 56 (Suppl. 1): S5-S16, IF =1.505(07) Mickova A, Tomankova K, Kolarova H, Bajgar R, Kolar P, Sunka P, Plencner M, Jakubova R, Benes J, Kolacna L, Planka L, Necas A, Amler E. Ultrasonic shock-wave as a control mechanism for liposome drug delivery system for possible use in scaffold implanted to animals with iatrogenic articular cartilage defects. Acta Vet Brno 2008, 77, 285-289, IF = 0.687 (07) Filová E, Jelínek F, Handl M, Lytvynets A, Rampichová M, Varga F, Činátl J, Soukup T, Trč T, Amler E. Novel Composite Hyaluronate/ Type I Collagen /Fibrin Scaffold Enhances Repair of Osteochondral Defect in Rabbit Knee. J Biomed Mater Res B Appl Biomater. 2008; 87(2):415-24, IF = 1.933(07) Plánka L, Gál P, Kecová H, Klíma J, Hlučilová J, Filová E, Amler E, Krupa P, Křen L, Srnec R, Urbanová L, Lorenzová J, Nečas A. Allogeneic and autogenous ransplantations of MSCs in treatment of the physeal bone bridge in rabbits. BMC Biotechnol. 2008, 8:70, IF = 2.747(07) Plánka L, Nečas A, Srnec R, Raušer P, Starý D, Jančář J, Amler E, Filová E, Hlučilová J, Křen L, Gál P.Use of allogenic stem cells for the prevention of bone bridge formation in miniature pigs. Physiol Res. 2008 Dec 17, accepted, [Epub ahead of print], IF =1.505(07) G, Kolacna L, Schoner W, Amler A. The π-helix formation between Asp^369 and Thr^375as a key factor in E1-E2 conformational change of Na^+/K^+-ATPase. Physiol Res, accepted, 2008 Jul 25. [Epub ahead of print], IF =1.505(07) Amler E, Blažek T, Heřmanská J, Koláčná L, Kotyk A, Vackářová J, Varga F. Paktické úlohy z biofyziky I. Ústav biofyziky UK, 2. lékařské fakulty, Praha, 2006. Amler E, Buzgo M, Filová E, Jakubová R, Koláčná L, Kotyk A, Míčková A, Plencner M, Prosecká E, Rampichová M, Varga F, Zavřelová T. Lékařské textilie – 1. díl.; Centrum pro podporu konkurenceschopnosti v biomedicínských technologiích; Amler E (ed), Ústav experimentální medicíny AV ČR, v.v.i., Praha, 2008 Amler E, Čapek L, Koláčná L, Košťáková E, Lukáš D, Martinová L, Novák O, Vodseďálková K Lékařské textilie – 2. díl.; Centrum pro podporu konkurenceschopnosti v biomedicínských technologiích; Lukáš D, Martinová L (eds), Vydala Asociace inovačního podnikání ČR, 2008