The platon crystallographic package

1.3.6.8 – ASYM-VALIDATION
This utility differs from 'FCF-VALIDATION' in that Friedel Pairs are not averaged in the 
reflection count summary. This function offers validation of .fcf files (in combination with 
the associated .cif) for completeness and unusual features. The result of the analysis can be 
found in name.ckf. Note: The 'data_' names in the .cif and .fcf should be identical. 
1.3.6.9 - SUPPLEMENTARY MATERIAL
Generation of A4 formatted crystal data summary and  coordinate, displacement parameter, 
bonds, angles, torsion angle and hydrogen bond tables, suitable as printable supplementary 
material. 
1.3.6.10 – EXPECT-HKL – Estimate Number of expected reflections 
An estimate of the number of reflections to be expected for the unit cell given in the 
supplied .res, .cif or .spf data as a function of the resolution and CuKa or MoKa radiation. 
This estimate is approximate and usually deviates significantly from exact counts obtained 
with the ASYM-EXPECT tool for small unit cells and cells with a significant amount of 
systematic absences. 
1.3.6.11 - PLATON CSD-CELL – Search the CSD for Related Lattices
 
PLATON generates, when invoked by clicking on CSD-CELL with a .res, .cif or .res , a 
.que file containing a search request for the CONQUEST program (cqbatch). Subsequently 
the cqbatch program is executed, when accessible, from the current PLATON session. The 
environment variable CSDHOME is assumed to be set. Optionally, a CONQUEST 
environment variable can be set with QUESTEXE to cqbatch. The search is on structures 
with similar lattices. A multiple entry CIF will be created. The ORTEP tool is automatically 
invoked to loop through the entries by clicking on the Next button in the side menu.
1.3.6.12 - CSD-QUEST Interface – Search the CSD for Related Structures
PLATON generates, when invoked by clicking on CSD-QUEST with a .res, .cif or .res,  a 
.que file containing a search request for the CONQUEST program (cqbatch). Subsequently 
the cqbatch program is executed, when accessible, from the current PLATON session. The 
environment variable CSDHOME is assumed to be set. Optionally, a CONQUEST 
environment variable can be set with QUESTEXE to cqbatch. This tool should be useful to 
find related published work (including information on whether this structure was published 
previously). A search on the main residues (i.e. residues with more than 9 atoms) is done 
only for generality. Bonds to metals (often ambiguous) are not included in the search 
request. A multiple entry CIF will be created. The ORTEP tool is automatically invoked to 
loop through the entries by clicking on the Next button in the side menu.
1.3.6.13 - STRUCTURE TIDY – Standardized Inorganic Structure Data
This is a PLATON implementation of the STRUCTURE TIDY (Parthe & Gelato (1984); 
Gelato & E.Parthe (1987); Hu & E.Parthe (2004)) program for the standardization of 
Inorganic crystal structure data. Invocation with a .res, .cif or .spf structured file will 
generate a .sty styled file suitable to run STRUCTURE TIDY (optionally edited) in the 
native mode. STRUCTURE TIDY as implemented in PLATON has two entry points: 

---

1 - Embedded: In this mode STRUCTURE TIDY is both callable from the the PLATON 
main menu or with an instruction (STIDY) entered in the command window. 
Example: Invoke platon compound_name.cif and click on 'StructureTidy. 
Input data for SeEu compound in I4/mcm
 (st.spf) with listed output on 
(ASCII)
 or 
(PostScript)
. 
2 - Native: In this mode a data file structured following the Structure Tidy style should be 
provided. Example Invoke platon -Y data.sty. 
Alternatively, with a symbolic link of 'stidy' to the platon executable: invoke stidy data.sty.
 
1.3.6.14 - Strain Analysis
This routine carries out a strain analysis based on an algorithm described by Ohashi & 
Burnham (1973). See also: Hazen & Finger (1982). The required data are the unit cell data 
for two cells at different temperatures, optionally with their su's. 
Example input file: (strain.spf) 
TITL LOW ALBITE at 26 and 1127 Degrees C
CELA 8.141 12.79 7.157 94.225 116.597 87.772 26.0
CELB 8.278 12.863 7.180 92.780 116.045 87.718 1127
CSUA 0.007 0.009 0.004 0.058 0.048 0.052
CSUB 0.006 0.009 0.003 0.067 0.037 0.055
Output on strain.lis: 
Titl: LOW ALBITE UNIT-CELL STRAIN   26 TO 1127 C (STEWART + VON LIMBACH, 1967)    
Cell Parameters
===============
Before:     8.14100    12.79000     7.15700    94.22500   116.59700    87.77200   at     26.00 Deg. 
After:      8.27800    12.86300     7.18000    92.78000   116.04500    87.71800   at   1127.00 Deg. 
Standard Deviations For Cell 1:
            0.00700     0.00900     0.00400     0.05800     0.04800     0.05200
Standard Deviations For Cell 2:
            0.00600     0.00900     0.00300     0.06700     0.03700     0.05500
Angles Between XYZ and ABC Systems               Strain Tensor Based on XYZ
=====================================================================================
         +A       +B       +C
+X     26.60    90.00    90.00            0.2149069E-01  0.7216585E-02  0.1418302E-02
+Y     89.66     4.22    90.00            0.7216585E-02  0.7261276E-02  0.1260034E-01
+Z    116.60    94.22     0.00            0.1418302E-02  0.1260034E-01  0.3213644E-02
Strain Ellipsoid
================
            Strain  Unit Strain            Angle with            Rho       Phi    Proj.X   Proj.Y   Hemisphere
                                       +X       +Y       +Z
Axis-1  0.2663E-01   0.2419E-04      36.88    59.54    71.27   71.27     32.36     60.5     38.4        +
Axis-2  0.1332E-01   0.1210E-04     125.89    56.90    53.24   53.24    137.04    -36.7     34.2        +
Axis-3 -0.7989E-02  -0.7256E-05      82.65   131.84    42.78   42.78    -79.14      7.4    -38.5        +
Crystallographic Axes
=====================
+A-Axis                              26.60    89.66   116.60  116.60      0.38     61.8      0.4        -
+B-Axis                              90.00     4.22    94.22   94.22     90.00      0.0     92.9        -
+C-Axis                              90.00    90.00     0.00    0.00      0.00      0.0      0.0        +
            Strain     (Error) Unit Strain     (Error)                          Angle With
==============================================================================================================
                                                             +A  (Error)        +B  (Error)        +C  (Error)
Axis-1  0.2663E-01( 0.125E-02)  0.2419E-04( 0.113E-05)     54.94(  3.50)      61.19(  2.44)      71.27(  2.31)
Axis-2  0.1332E-01( 0.902E-03)  0.1210E-04( 0.820E-06)    142.09(  3.57)      59.97(  2.62)      53.24(  1.97)
Axis-3 -0.7989E-02( 0.100E-02) -0.7256E-05( 0.912E-06)    102.60(  1.56)     135.99(  1.39)      42.78(  1.52)
Volume  0.3197E-01( 0.176E-02)  0.2903E-04( 0.160E-05)

---