«megnevezes»
Yüklə 4,43 Mb. Pdf görüntüsü
|
OOF-BIN B IOINFORMATIKA
D R . G RAMA L ÁSZLÓ , egyetemi docens
Biofizikai Intézet 2 kredit ▪ félévközi jegy ▪ Fakultatív modul ▪ tavasszal ▪ ajánlott félév: 4. Foglalkozás/félév: 0 óra előadás + 14 óra gyakorlat + 14 óra szeminárium = összesen 28 óra Kurzus létszámkorlát: min. 5 fő – max. 18 fő Előfeltételek: OOA-MB1 teljesített Foglalkozás-egészségügyi vizsgálaton szerzett ALKALMAS minősítés esetén vehető csak fel! Tematika Egy egyszerű meghatározás szerint a bioinformatika molekuláris biológia számítógépen. Mára, többek között a Humán Genom Projektnek köszönhetően, döbbenetes mennyiségű információ áll rendelkezésre génjeinkről és fehérjéinkről. Mit kezdhetünk ezzel az információval? A bioinformatika célja ezen adatok rendszerezése, a számunkra fontos adatok megkeresése és elemzése. Tantárgyunk ebbe nyújt bepillantást. Olyan kérdésekre keressük majd a választ, mint pl. - hogyan kereshetjük meg egy adott fehérje DNS és aminosav szekvenciáját az interneten? - hogyan különíthetők el egy génen belül a kódoló és nem kódoló régiók? - hogyan jósolhatók meg DNS és fehérjemolekulák tulajdonságai a szekvenciájuk alapján? - hogyan tervezhetjük meg egy fehérje klónozását? - mennyire hasonlít ugyanaz a fehérje emberben és egérben? - hogyan jósolható meg egy fehérje 3D szerkezete? - hogyan ábrázolható és manipulálható egy fehérje 3D szerkezete? A tantárgy során a fenti és számos további kérdésnek nemcsak az elméleti alapjait beszéljük meg, de a hallgatók a módszereket a gyakorlatban is kipróbálhatják. A félév elfogadásának feltételei Legfeljebb 3 foglalkozásról történő hiányzás megengedett. Félévközi ellenőrzések Távolmaradás pótlásának lehetőségei Nincs.
A tananyag elsajátításához szükséges segédanyagok -
Kötelező irodalom -
Saját oktatási anyag http://biofizika.aok.pte.hu
-
Jegyzet -
Ajánlott irodalom Előadások Gyakorlatok 1 Bevezetés 2 Molekuláris biológiai alapok 3 Alapvető eszközökről röviden 4 Fehérje adatbázisok 5 Nukleotid adatbázisok 6 Gén és genom adatbázisok. Restrikciós térképezés 7 PCR primer tervezés. Plazmid térképek 8 Klónozási példafeladat 1 9 Klónozási példafeladat 2 10 Hasonlóságkeresés (BLAST) 11 Többszörös szekvenciaillesztés. Filogenetikai fák 12 3D fehérjeszerkezetek 13 Fehérjeszerkezetek előrejelzése, szimulációk 14 Publikációs adatbázisok. Referenciakezelés Szemináriumok 1 Bevezetés 2 Molekuláris biológiai alapok 3 Alapvető eszközökről röviden 4 Fehérje adatbázisok 5 Nukleotid adatbázisok 6 Gén és genom adatbázisok. Restrikciós térképezés 7 PCR primer tervezés. Plazmid térképek 8 Klónozási példafeladat 1 9 Klónozási példafeladat 2 10 Hasonlóságkeresés (BLAST) 11 Többszörös szekvenciaillesztés. Filogenetikai fák 12 3D fehérjeszerkezetek 13 Fehérjeszerkezetek előrejelzése, szimulációk 14 Publikációs adatbázisok. Referenciakezelés Vizsgakérdések http://biofizika.aok.pte.hu
Dr. Grama László (GRLHAAO.PTE), Dr. Kengyel András Miklós (KEAFACO.PTE), Dr. Talián Csaba Gábor (TACRAAO.PTE) OOF-CSU É LMÉNY - ÉS ÉLETSZERŰ BIOKÉMIA
D R . V ERES B ALÁZS , habilitált docens
Biokémiai és Orvosi Kémiai Intézet 1 kredit ▪ félévközi jegy ▪ Fakultatív modul ▪ tavasszal ▪ ajánlott félév: 4. Foglalkozás/félév: 14 óra előadás + 0 óra gyakorlat + 0 óra szeminárium = összesen 14 óra Kurzus létszámkorlát: min. 5 fő – max. 200 fő Előfeltételek: nincs Foglalkozás-egészségügyi vizsgálaton szerzett ALKALMAS minősítés esetén vehető csak fel! Tematika A tantárgy célja azon, a mindennapokból is ismert, témák biokémiai hátterének megvilágítása, amelyek érdeklődésre tarthatnak számot nem csak az orvosi tanulmányokat folytató hallgatók, de a természettudományok iránt érdeklődő más karon tanuló hallgatók körében is. A tematika igen széles spektrumot ölel fel, kifejezetten fókuszálva a legfrissebb kutatási eredményekre és az aktuális „tudományos trendekre” a szintetikus biológiától a sportban használt doppingszereken át egészen növények/gombák/állatok által termelt mérgek és toxinok biológiai hatásáig. A tantárgy külön blokkban foglalkozik az elmúlt évtized fizikai, kémiai és orvosi Nobel-díjaival bepillantást engedve e „trendmeghatározó” területekre.
Legfeljebb 15 % hiányzás megengedett Félévközi ellenőrzések TVSz
Távolmaradás pótlásának lehetőségei Pótlásra nincs lehetőség. A tananyag elsajátításához szükséges segédanyagok -
Kötelező irodalom -
Saját oktatási anyag Az előadások anyaga, ami pdf formátumban a hallgatók rendelkezésére fog állni. A kapcsolódó irodalmat illetve internetes tartalmakat az előadások szintén tartalmazzák. -
Jegyzet Az előadások anyaga, ami pdf formátumban a hallgatók rendelkezésére fog állni. A kapcsolódó irodalmat illetve internetes tartalmakat az előadások szintén tartalmazzák. -
Ajánlott irodalom Az előadások anyaga, ami pdf formátumban a hallgatók rendelkezésére fog állni. A kapcsolódó irodalmat illetve internetes tartalmakat az előadások szintén tartalmazzák.
1 Humán genom projekt, humán génterápia, epigenetika Dr. Veres Balázs 2 DNS szekvenálás, PCR, helyszínelők Dr. Veres Balázs 3 Istent játszva: szintetikus biológia Dr. Veres Balázs 4 Az vagy, amit megeszel: GMO Dr. Veres Balázs 5 Superman: dopping a sportban és agyi doppingszerek Dr. Veres Balázs 6 Függő játszma: alkohol és drog biokémia Dr. Veres Balázs 7 Sejthalál: apoptózis, nekrózis, autofágia Dr. Veres Balázs 8 Rák, AIDS: terápiás lehetőségek biokémiai háttere Dr. Veres Balázs Yüklə 4,43 Mb. Dostları ilə paylaş:
|