The platon crystallographic package



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1.4.27 – S/EXOR – SubMenu #0
1.4.27.25 - ACCEPT-DEFAULT
Clicking on ACCEPT-DEF confirms the suggested default instruction or datum in []. 
1.4.28 – Radial Distribution Function - Sub-Menu #0
1.4.28.1 – Normalize - Toggle
Normalize.
1.4.28.2 – RDF-Radius 
Set maximum radius of the RDF. Click positions are 2.5, 5.0, 7.5, 10.0, 12.5 Angstrom. The 
default is 5.0 Angstrom.
1.4.28.3 - RDFwidtPar
Radius settings are 2.5, 5.0, 7.5, 10.0, 12.5, 15.0. The default value is 5.0
1.4.28.23 - Decoration
Exclude border information from display.
1.4.28.24 - EPS-File
Create hardcopy of display in PostScript format 
1.4.28.25 - END
Terminate program
1.4.29 – Bijvoet Pair Analysis  - Sub-Menu #0
1.4.29.1 - IcalcFromCIF/FCF Toggle 
The Bijvoet analysis is by default based on structure factors that are calculated from the data 
in the CIF. Alternatively, this analysis can be based on the calculated data in the .fcf. The 
latter analysis is only meaningful when the .fcf is produced without BASF/TWIN 
instructions. 
1.4.29.2 – InclWeightPar Toggle 
Toggle for including the weight parameters in sigma(I)
 
1.4.29.6 - Outlier Crit 
Selection criterium for the maximum absolute difference in the intensity of the Bijvoet pairs 
to be considered. Click positions give 'all', 1, 2, 3. etc times the maximum calculated Bijvoet 


difference. 
1.4.29.8 - SigmaCrit 
Selection criterium for the minimum absolute difference in the intensity of the observed Bijvoet 
pairs to be considered in the Scatter Plot. Click positions give 0.0, 0.25, 0.5, 1.0, 2.0 and 4.0 Sigma 
respectively. Where sigma is calculated from the sigma's of the two Friedel related reflections as: 
sqrt(sigma**2(F1**2) + sigma**2(F2**2)) 
 
1.4.29.13 – NPP-Bijvoet
Normal Probability Plot of Bijvoet Pairs
1.4.29.15 – Apply Slope Toggle 
Apply Normal Probability Plot Slope in Gaussian error distribution Model.
1.4.29.17 - Nu-Value 
This is the selectable value that is to be used in the Student-t distribution.
1.4.29.18 – Gaussian Toggle
Toggle to switch between the Gaussian and Student-t error distribution model.
                       
 
1.4.29.22 – HKL-Display Toggle
Toggle to switch between (yes/no) HKL display for data points.
1.4.29.23 – s.u-Bar Display Toggle
Toggle for the (yes/no) display of one sigma s.u. bars on data points.
1.4.29.24 - EPS-File
Clicking on this button will produce a copy of the current display in PostScript format. 
1.4.29.25 -  END 
Clicking on END will terminate the program. 
1.4.30 – Polyhedra – SubMenu #0
1.4.30.2 – Color Toggle 
 
1.4.30.3 – Perspective Toggle 
 


1.4.30.4 – InclHatoms – Toggle
 
 
                 
 
1.4.30.10 – View Options 
 
 
1.4.30.11 – Polyhedra Toggle
 
 
1.4.30.12 – PolyShade Toggle 
 
1.4.30.13 – UnitCell Box Toggle 
 
1.4.30.14 – Include Atoms Toggle 
 
1.4.30.16 – Pack Range 
 
1.4.30.17 – Omit Outside
                                                                  
1.4.30.19 - RotZ
 
Rotate around the Z axis perpendicular to the screen.
1.4.30.20 - RotY
 
Rotate around the vertical y axis.
 
1.4.30.21 - RotX
 
Rotate about the horizontal x axis
1.3.30.23 – Decoration Toggle
                                                                  
                     
Exclude option of border information from display.
1.4.30.24 - B&W-EPS-COL
 
Create either Black and White or Color hardcopy of the display.
 


1.4.30.25 – END 
 
This will end the program
1.4.31 – FLIPPER – SubMenu #0
1.4.31.10 - NTRY
Option for the manually setting of the maximum number of flipping trials
1.4.31.11 - NLOOP
Option for the manually setting of the maximum number of flip loops.
1.4.31.12 - NSOLVE
Option for the manually setting of the maximum number of solutions. The procedure is 
stopped when nsolve solutions are found.
1.4.31.13 - DELTA
Option for manually setting of the flip factor delta. This determines the level at which the 
sign of the electron density in the map is changed.
1.4.31.14 - PERC 
Option for the setting of the phase shift percentage. This determines the percentage of the 
weakest reflection for which the phase is shifted by 90 degrees.
1.4.31.15 - UISO
Option to manually set the value of the normalizing (pseudo) Uiso value. This value is used 
to (pseudo-) normalize the reflection intensities.
1.4.31.21 -  Structure Option Toggle
This option will display the progress of the flipping procedure in terms of the result of a 
peak search after every flip cycle.
 
1.4.31.22 – Show Option 
This option will display the progress of the flipping procedure in terms of the result of a 
peak search after every flip cycle.
1.4.31.23 – Continue after Interrupt
The flipping process can be interrupted by clicking in the graphics window. Clicking in this 
box will continue the flipping cycle. 
1.4.31.24 – Converged 
The flipping process can be interrupted by clicking in the graphics window. Clicking in this 
box will signal convergence and start the structure 'work-up' step.
1.4.31.25 – End 


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