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Stochastic r — The mean rate of stochastic population growth or decline 

demonstrated by the simulated populations, averaged across years and iterations, 

for all those simulated populations that are not extinct. This population growth rate 

is calculated each year of the simulation, prior to any truncation of the population 

size due to the population exceeding the carrying capacity. Usually, this Stochastic 

r will be less than the deterministic r predicted from birth and death rates. The 

Stochastic r from the simulations will be close to the deterministic r if the 

population growth is steady and robust. The Stochastic r will be notably less than 

the deterministic r if the population is subjected to large fluctuations due to 

environmental variation, catastrophes, or the genetic and demographic instabilities 

inherent in small populations. 

P(E) — the probability of population extinction, determined by the proportion of, 

for example, 500 iterations within that given scenario that have gone extinct in the 

simulations. "Extinction" is defined in the VORTEX model as the lack of either 

sex. 

N — mean population size, averaged across those simulated populations which are 



not extinct. 

SD(N) — variation across simulated populations (expressed as the standard 

deviation) in the size of the population at each time interval. SDs greater than about 

half the size of mean N often indicate highly unstable population sizes, with some 

simulated populations very near extinction. When SD(N) is large relative to N, and 

especially when SD(N) increases over the years of the simulation, then the 

population is vulnerable to large random fluctuations and may go extinct even if the 

mean population growth rate is positive. SD(N) will be small and often declining 

relative to N when the population is either growing steadily toward the carrying 

capacity or declining rapidly (and deterministically) toward extinction. SD(N) will 

also decline considerably when the population size approaches and is limited by the 

carrying capacity. 

H — the gene diversity or expected heterozygosis of the extant populations, 

expressed as a percent of the initial gene diversity of the population. Fitness of 

individuals usually declines proportionately with gene diversity (Lacy 1993b), with 

a 10% decline in gene diversity typically causing about 15% decline in survival of 

captive mammals (Ralis et al. 1988). Impacts of inbreeding on wild populations are 

less well known, but may be more severe than those observed in captive 

populations (Jimenez et al. 1994). Adaptive response to natural selection is also 

expected to be proportional to gene diversity. Long-term conservation programs 

often set a goal of retaining 90% of initial gene diversity (Soulé et al. 1986). 

Reduction to 75% of gene diversity would be equivalent to one generation of full-

sibling or parent-offspring inbreeding. 



LITERATURE CITED 

Gilpin, M.E., and M.E. Soulé. 1986. Mínimum viable populations: processes of 

species extinction. Pages 19-34 in: Soulé, M.E. (ed.). Conservation Biology: The 

Science of Scarcity and Diversity. Sunderland, MA: Sinauer Associates. 

Jimenez, J.A., K.A. Hughes, G. Alaks, L. Graham, and R.C. Lacy. 1994. An 

experimental study of inbreeding depression in a natural habitat. Science 

266:271-273. 

Lacy, R.C. 1993a. 

VORTEX

:

 

A computer simulation model for Population 



Viability Analysis. Wildlife Research 20:45-65. 

Lacy, R.C. 1993b. Impacts of inbreeding in natural and captive populations of 

vertebrates: 

implications for conservation. Perspectives in Biology and Medicine 36:480-496. 

Lacy, R.C. 1993/1994. What is Population (and Habitat) Viability 

Analysis? Primate Conservation 14/15:27-33. 

Miller, P.S., and R.C. Lacy. 1999. 

VORTEX

:

 

A Stochastic Simulation of the 

Extinction Process. Version 8 User's Manual. Apple Valley, MN: Conservation 

Breeding Specialist Group (SSC/IUCN). 

Ralis, K., J.D. Ballou, and A. Templeton. 1988. Estimates of lethal equivalents and 

the cost of inbreeding in mammals. Conservation Biology 2:185-193. 

Shaffer, M.L. 1981. Minimum population sizes for species conservation. 

BioScience 1:131-134. 

Soulé, M., M. Gilpin, W. Conway, and T. Foose. 1986. The millennium ark: How 

long a voyage, how many staterooms, how many passengers? Zoo Biology 

5:101-113. 




Una metodología para analizar la población de jaguares en Mesoamerica 

Philip Miller, CBSG 

 

 



Introducción 

El jaguar se encuentra distribuido a través de Mesoamerica en una serie de parches de bosque 

fragmentados. Como resultado, y habiendo un aumento en la presión debido a las actividades 

humanas en la región, cada una de estas poblaciones enfrenta un aumento en el riesgo de  

declinación en el futuro y tal vez hasta la extinción. El Programa de Conservación de Jaguares, 

iniciado por la Sociedad de Conservación de la Vida Silvestre, ha identificado un grupo 

prioritario de Unidades de Conservación del Jaguar desde el norte de México hasta el norte de la 

Argentina, que puede ser utilizado para identificar actividades específicas para aplicar a las 

poblaciones individuales en riesgo. Estas Unidades están basadas primordialmente en la 

identificación de hábitat adecuado para el jaguar y en la observación histórica de jaguares en el 

área. 

 

Como una manera de proveer discernimiento adicional en la priorizacion de estas Unidades de 



Conservación, es necesario enfocar nuestro análisis en el nivel poblacional. Más 

específicamente, una evaluación de la demografía específica de la edad para la población tasas 

de sobrevivencia y reproducción- puede proveer información valiosa para ampliar nuestro 

conocimiento de la viabilidad futura de una población. Sin embargo, muy poca información de 

este tipo existe para ninguna población de jaguares en Mesoamerica. Debido a este limitante, 

utilizamos  VORTEX, un paquete de software para el análisis de la viabilidad de la población, 

como una herramienta de instrucción para estimular la discusión entre los participantes del taller 

sobre el papel vital que juega la información demográfica en la evaluación del riesgo de la 

declinación poblacional y la extinción. 

 

VORTEX es una simulación de los efectos de las fuerzas determinísticas, así como de los 

eventos demográficos, ambientales y genéticos estocásticos (al azar e impredecibles) en las 

poblaciones silvestres. VORTEX modela la dinámica poblacional como una secuencia discreta 

de eventos (p.e. nacimientos, muertes, proporción de sexos entre los recién nacidos, catástrofes, 

etc.) que ocurren de acuerdo a probabilidades definidas. La probabilidad de los eventos es 

modelada como constantes o variables al azar que siguen distribuciones específicas. El paquete 

simula una población siguiendo la serie de eventos que describe el ciclo de vida típico de 

muchos organismos. 

 

VORTEX no intenta brindar respuestas absolutas, ya que está proyectando las interacciones de 

los muchos parámetros utilizados como información introducida al modelo y debido a los 

procesos al azar involucrados en la naturaleza. La interpretación de los resultados depende de 

nuestro conocimiento de la biología del jaguar, las condiciones ambientales que afectan una 

población dada, y los posibles cambios de estas condiciones. De hecho, pronto se hizo claro 

durante este taller que no era posible un análisis detallado de la viabilidad de poblaciones 

individuales del  jaguar debido a la falta de información demográfica de campo apropiada. 

Consecuentemente, el modelo fue utilizado para demostrar los tipos de análisis que son posibles 

y las maneras en que pueden ser utilizados para guiar la investigación y los esfuerzos de manejo  

en el futuro.   

 

Para una explicación más detallada del VORTEX y su uso en análisis de viabilidad de 



poblaciones, refiérase a Miller y Lacy (1999) y a Lacy (2000). 

 

Información introducida al modelo VORTEX para una población hipotética de jaguares 

Ante la ausencia de información demográfica detallada sobre las poblaciones de jaguares en la 

región, construimos un conjunto de información hipotética basada en la experiencia con otros 




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