The platon crystallographic package

menu-box. 
1.4.22.20 - DEFINE CONTOUR LEVEL
The current contour level step is shown above the contoured map, next to the map-type. The 
contour level step size (e/Ang**3) can be changed by clicking on this button and enter the 
desired level from the keyboard. Alternatively, the keyboard instruction CL value can be 
given. 
1.4.22.21 - Omit on SIGI & (XR/YR/ZR) Rotations
Depending on the context: 
- Omit 0, 1 or 2 Sigma Iobs data from the Fourier Map Calculation. 
- XR, YR & ZR buttons, when pressed allow for the rotation of the molecular display in 
order to (de)select clickable atoms. 
In the Contour map plot mode, only ZR is active. The default rotation about Z is 10 
degrees. 
1.4.22.22 - OMIT Atoms From Structure Factor Calculation
For various reasons it might be advantageous to omit explicitly mentioned atoms present in 
the input data prior to a (differerence) Fourier map calculation. 
This function can be accomplished by clicking on 'OMITFromSFC'. Following clicks on 
atoms (in the asymmetric) unit will mark them for omission (though their coordinates will 
be retained for display purposes). The sequence of to be omitted atoms is completed by 
clicking on OMITFromSFC again. 
A useful application might be the corroboration op H-atom positions (e.g. Methyl moieties). 
1.4.22.23 - DECORATION Toggle
The boundary information (title, rotation angles etc.) may be switched (on/off) by clicking 
on DECORATION. 
1.4.22.24 - Up Down
A Fourier map section one step UP is calculated and contoured. The current step-size is 
shown above the contoured map. A Fourier map section one step down is calculated and 
contoured. The step size is shown above the contoured map. 
1.4.22.25 - EPS hardcopy and End.
Generate a copy of the current contour map on the graphics canvas as a META file. 
The default on the META-file is Encapsulated PostScript. 
The default can be changed (in the PLATON main menu) with one of the following 

---

instructions: SET META HPGL or SET META PS
END terminates the calculation. 
1.4.23 – CONTOUR SUB-MENU #1
1.4.23.1 – Contour memu.sub-menu toggle
1.4.23.2 - Fo**2-Map 
1.4.23.8 - Nr-Sections
Change default for .fou file generation. 
Set # of sections on the negative side of the current section (Default = 5). 
Depending on the click position, 1, 3, 5, 7 or 9 sections on the negative side will be 
included. 
1.4.23.9 - Nr+Sections 
Change default for .fou file calculation. 
Change default of positive sections above current section (Default = 5). 
Depending on the click position, 1, 3, 5, 7 or 9 sections will be included on the positive side. 
1.4.23.10 - Fourier3D
 
Generate .fou file for 3D Map inspection with Fourier3D (Duncan Tooke) or MCE (Hasek)
 
1.4.23.18 - SECTION STEP SIZE
The section step size (Default 0.3 Angstrom)is shown above the contoured map. 
The step size may be set to another value by position sensitive clicking in the menu box. 
1.4.24 – SOLV – SubMenu #0
1.4.24.2 - Stereo/Mono
Toggle to switch from stereo to mono display. The Left click position generates a 
RED/GREEN display. The Right click position generated the two images next to one 
another. 
 
1.4.24.3 - DOTS/CONTOUR
Toggle for the selection of DOT or Contour type display of the outline of the voids. 

---

1.4.24.4 - ViewXo
View down the cartesian X-direction. 
1.4.24.5 - ViewYo 
View down the cartesian Y direction. 
1.4.24.6 - SOLV - ViewZo
View down the cartesian Z direction. 
 
1.4.24.7 -  
1.4.24.8 - VOIDAXES
T
oggle for for the display of Maximum Void dimensions along the eigenvectors calculated 
from the grid point distribution. 
1.4.24.9 - UnitSymmPack
Fill Unit cell with copies of the molecules in the asymmetric unit. 
1.4.24.10 - PLOT - DISPLAY BY RESIDUE
This button contains NRES (= number of species) + 1 clickable boxes. By default, all 
residues are drawn. This corresponds to the leftmost click position. The other click positions 
bring up individual residues. The number of the residue displayed is shown on the drawing. 
The number 0 indicates that all residues are shown. 
1.4.24.11 - UNITFILL
Toggle to switch between the display of closed solvent accessible areas and the display of 
solvent accessible areas within the unit cell confinement. 
1.4.24.12 - VOID0123..
Display either all or designated void outlines, determined by the click position. 
1.4.24.13 - UnitCellBox
Toggle for the display of the Unit cell outline. 
1.4.24.14 - Show-Mol
Toggle for the display of the (ordered) structure part.. 

---

1.4.24.15 - Ohashi
Toggle to switch between the Solvent accessible Volume and 'Ohashi' Volume display. 
1.4.24.16 - LabelCell
Toggle for the display of unit cell labels. 
1.4.24.17 - Label
Toggle for the display of atom labels. 
1.4.24.18 - Label Size
The label size can be globally changed as a function of the click position.
1.4.24.19 - RotZ
Rotation about an axis perpendicular to the display. The clicking position determines the 
magnitude and direction of the rotation. 
1.4.24.20 - RotY
Rotation about the vertical Y-axis. The clicking position determines the magnitude and 
direction of the rotation. 
1.4.24.21 - RotX
Rotation about the horizontal X-axis. The clicking position determines the magnitude and 
direction of the rotation. 
1.4.24.22 - COLOR
Color Toggle in non-Red/Green Stereo mode. 
1.4.24.23 - Decoration
Toggle for the display/removal of the border text. 
1.4.24.24 - EPS
Clicking on this button will generate a PostScript copy of the display. 
1.4.24.25 - END
Clicking on this button will end the SOLV session.
 
1.4.25 – TwinRotMat – SubMenu #0

---