Transkriptomika, transkripsiya faktorlari, oqsillar polimorfizmi, oqsil folding, molekulyar shaperonlar, genomning regulyator, transkripsiya, translyasiya qismlari

Transkriptomikadan oldin
Shaxsni o'rganish stenogrammalar transkriptomika yondashuvlari mavjud bo'lishidan bir necha o'n yillar oldin amalga oshirilgan. Kutubxonalar ning ipak kuya mRNA transkriptlari to'planib, ularga o'tkazildi bir-birini to'ldiruvchi DNK (cDNA) yordamida saqlash uchun teskari transkriptaz 1970-yillarning oxirlarida.^[13] 1980-yillarda Sanger usuli tasodifiy transkriptlarni ketma-ketligi, ishlab chiqarish uchun ishlatilgan ifodalangan ketma-ketlik teglari (EST).^{[2][14][15][16]} The Sangerning ketma-ketlik usuli paydo bo'lishiga qadar ustunlik qilgan yuqori ishlash usullari kabi sintez bilan ketma-ketlik (Solexa / Illumina). ESTlar ni aniqlashning samarali usuli sifatida 1990-yillarda mashhurlikka erishdi genlarning tarkibi bo'lmagan organizmning ketma-ketlik butun genom.^[16] Shaxsiy transkriptlar miqdori yordamida miqdoriy aniqlandi Shimoliy blotting, neylon membrana massivlariva keyinroq teskari transkriptaz miqdoriy PCR (RT-qPCR) usullari,^[17][18] ammo bu usullar juda mashaqqatli va faqat transkriptomning kichik bir qismini olish mumkin.^[12] Binobarin, transkriptomni bir butun sifatida ifodalash va tartibga solish usuli yuqori samaradorlik texnikasi ishlab chiqilmaguncha noma'lum bo'lib qoldi.
Dastlabki urinishlar
"Transkriptom" so'zi birinchi marta 90-yillarda ishlatilgan.^[19][20] 1995 yilda birinchi navbatda ketma-ketlikka asoslangan transkriptomik usullardan biri ishlab chiqilgan, gen ekspressionining ketma-ket tahlili Tomonidan ishlangan (SAGE) Sanger ketma-ketligi birlashtirilgan tasodifiy transkript fragmentlari.^[21] Transkriptlar fragmentlarni ma'lum genlarga moslashtirish orqali miqdoriy aniqlandi. Raqamli gen ekspresiyasi tahlili deb nomlangan yuqori samaradorlikdagi sekvensiya usullaridan foydalangan holda SAGE-ning bir varianti ham qisqacha ishlatilgan.^[9][22] Biroq, ushbu usullar asosan transkriptlarning yuqori o'tkazuvchanligi ketma-ketligi bilan o'zlashtirildi, bu esa transkript tuzilishi haqida qo'shimcha ma'lumotlarni taqdim etdi. qo'shilish variantlari.