Šifra predmeta:
|
2605
|
Naziv predmeta:
|
FUNKCIONALNA GENOMIKA
|
OPĆI PODACI:
|
Studijski program:
|
Molekularne bioznanosti
|
Modul:
|
Biomedicina
|
Nositelj predmeta:
|
Dr. sc. Marijeta Kralj, znastvena savjetnica
|
Ustanova nositelja predmeta:
|
Institut "Rudjer Bošković", Zavod za molekularnu medicinu
|
Suradnici – izvoditelji:
|
Dr. sc. Koraljka Gall-Trošelj, znanstveni suradnik
Mr- sc. Mirela Sedić, Mr. sc. Sandra Kraljević, IRB
|
Status predmeta:
|
obvezni x izborni
|
Godina i semestar u kojem se predmet predaje:
|
I. godina, II. semestar
|
Cilj predmeta:
|
|
Stjecanje uvida u suvremenu tehnologiju korištenu u analizi ekspresije i funkcije gena i proteina, važnosti kompjuterske obrade podataka (bioinformatike) te ogromnih mogućnosti korištenja ovh metoda u osnovnom istraživanju, dijagnostici, prognostici i otkriću novih lijekova.
|
Sadržaj predmeta:
|
|
Funkcionalna genomika temelji se na eksperimentima kojima se obuhvaća analiza širokog raspona gena i/ili proteina te kompjuterskoj analizi dobivenih rezultata. Osnovna strategija rada u području funkcionalne genomike jest širenje raspona istraživanja nekog biološkog uzorka tako da se sa analize pojedinog gena (proteina), prelazi na sustavno proučavanje aktivnosti mnoštva njih odjednom. Funkcionalna genomika za cilj ima objediniti i povezati informaciju koju nam daju sekvence gena sa njegovom funkcijom a sve to kako bi se dobio uvid u procese nekog biološkog sustava.
Teme: Uvod u funkcionalnu genomiku, tehnologija DNA čipova, snovni principi proteomike, pregled tehnika koje se koriste u proteomici s posebnim naglaskom na "diferencijalno" profiliranje, identifikaciju proteina i post-translacijskie modifikacije, otkriće gena u zdravim organizmima i u bolesnim stanjima, određivanje funkcije gena, genska i ciljana terapija, farmakogenomika i toksikogenomika, molekularni portreti raka, molekularni portreti odgovora na terapiju raka, značaj bioinformatike.
|
Ishodi učenja: kompetencije, znanje, vještine koje predmet razvija
|
|
Predmet razvija znanje o novim tehnologijama širokog raspona (teoretsko i praktično), daje uvid u mogućnosti korištenja tih tehnologija u istraživanju funkcija stanica u zdravlju i bolesti te uvid u potrebu interdisciplinarnih istraživanja i kompjuterske obrade podataka.
|
Satnica, način izvedbe i ECTS koeficijent opterećenja studenta
|
ECTS bodovi
|
3
|
Broj sati
|
Predavanja
|
5
|
Seminari
|
5
|
Vježbe
|
5
|
Ukupno
|
15
|
NAČIN IZVOĐENJA NASTAVE I USVAJANJA ZNANJA
|
Predavanja
|
Seminari
|
Vježbe
|
Radionice
|
Samostalni zadaci
|
Multimedija i internet
|
Obrazovanje na daljinu
|
Konzultacije
|
Rad u laboratoriju
|
Mentorski rad
|
Terenska nastava
|
Napomene:
|
Obveze studenata: redovito pohađanje nastave i obavezno pohađanje vježbi
|
Praćenje i ocjenjivanje studenata (označiti masnim tiskom samo relevantne kategorije)
|
Pohađanje nastave
|
Aktivnosti u nastavi
|
Obvezan seminarski rad
|
Vježba ili case study
|
Način ocjenjivanja:
|
Pismeni ispit
|
Usmeni ispit
|
Esej/Seminar
|
Prikaz slučaja
|
Analiza objavljene publikacije
|
Projekt
|
Kontinuirana provjera znanja u tijeku nastave
|
Prezentacija
|
Praktičan rad
|
Obvezna literatura:
|
|
Koristiti će se recentne znanstvene publikacije (znanstveni i pregledni članci) koji pokrivaju područje funkcionalne genomike.
-
Friend SH, Stoughton RB: The magic of microarrays. Sci. Am. February 34-41, 2002.
-
Snijders AM, Meijer GA, Brakenhoff RH, van den Brule AJC, van Diest PJ. Microarray techniques in pathology: tool or toy. J. Clin. pathol: Mol. Pathol, 53:289-294, 2000.
-
Debouck C, Metcalf B. The impact of genomics on drug discovery. Annu. Rev. Pharmacol Toxicol. 40:193-208, 2000.
-
Young RA. Biomedical discovery with DNA arrays. Cell, 102:9-15, 2000.
-
Graves PR, Haystead AJT. Molecular biologist's guide to proteomics. Microbiol. Mol. Biol. Rev. 66:39-63, 2002.
-
Pandey A, Mann M. Proteomics to study genes and genomes. Nature, 405:837-846, 2000.
|
Dopunska (preporučena) literatura:
|
| -
Macgregor PF, Squire JA. Application of microarrays to the analysis of gene expression in cancer. Clin. Chem. 48:1170-1177, 2002.
-
Mohr S, Leikauf GD, Keith G. Rihn BH. Microarrays as cancer keys: an array of possibilities. J. Clin. Oncol. 20:3165-3175, 2002.
-
Wu W, Hu W, Kavanagh JJ. Proteomics in cancer research. Int. J. Gynecol. Cancer. 12:409-423, 2002.
|
Način praćenja kvalitete i uspješnosti izvedbe (evaluacija):
|
|
Uspješnost kolegija će evaluirati svake godine zajedničko stručno povjerenstvo Instituta Ruđer Bošković, Sveučilišta u Dubrovniku i Sveučilišta u Osijeku, a voditelji će putem ankete od polaznika dobiti informacije o primjerenosti programa i uspješnosti od strane voditeljstva.
|
Dostları ilə paylaş: |