The Journal of Experimental Biology

The Journal of Experimental Biology

590

Funayama, N. (2013). The stem cell system in demosponges: suggested involvement

of two types of cells: archeocytes (active stem cells) and choanocytes (food-

entrapping flagellated cells). Dev. Genes Evol. 223, 23-38. 

Funayama, N., Nakatsukasa, M., Hayashi, T. and Agata, K. (2005a). Isolation of the

choanocyte in the fresh water sponge, Ephydatia fluviatilis and its lineage marker, Ef

annexin. Dev. Growth Differ. 47, 243-253. 

Funayama, N., Nakatsukasa, M., Kuraku, S., Takechi, K., Dohi, M., Iwabe, N.,

Miyata, T. and Agata, K. (2005b). Isolation of Ef silicatein and Ef lectin as molecular

markers for sclerocytes and cells involved in innate immunity in the freshwater

sponge Ephydatia fluviatilis. Zoolog. Sci. 22, 1113-1122. 

Funayama, N., Nakatsukasa, M., Mohri, K., Masuda, Y. and Agata, K. (2010). Piwi

expression in archeocytes and choanocytes in demosponges: insights into the stem

cell system in demosponges. Evol. Dev. 12, 275-287. 

Gauthier, M. and Degnan, B. M. (2008). The transcription factor NF-kappaB in the

demosponge Amphimedon queenslandica: insights on the evolutionary origin of the

Rel homology domain. Dev. Genes Evol. 218, 23-32. 

Gauthier, M. E. A., Du Pasquier, L. and Degnan, B. M. (2010). The genome of the

sponge  Amphimedon queenslandica provides new perspectives into the origin of

Toll-like and interleukin 1 receptor pathways. Evol. Dev. 12, 519-533. 

Gerrodette, T. and Flechsig, A. O. (1979). Sediment-induced reduction in the

pumping rate of the tropical sponge Verongia lacunosa. Mar. Biol. 55, 103-110. 

Halverson, G. P., Hurtgen, M. T., Porter, S. M. and Collins, A. S. (2009).

Neoproterozoic-Cambrian biogeochemical evolution. In Neoproterozoic-Cambrian

Tectonics, Global Change and Evolution: a Focus on South Western Gondwana (ed.

C. Gaucher, A. N. Sial, G. P. Halverson and H. E. Frimmel), pp. 351-365.

Amsterdam: Elsevier.

Hedner, E., Sjögren, M., Frändberg, P.-A., Johansson, T., Göransson, U.,

Dahlström, M., Jonsson, P., Nyberg, F. and Bohlin, L. (2006). Brominated

cyclodipeptides from the marine sponge Geodia barretti as selective 5-HT ligands. J.

Nat. Prod. 69, 1421-1424. 

Heintzen, C. (2012). Plant and fungal photopigments. Wiley Interdiscip. Rev. Membr.

Transp. Signal. 1, 411-432.

Hernandez-Nicaise, M.-L., Mackie, G. O. and Meech, R. W. (1980). Giant smooth

muscle cells of Beroe. Ultrastructure, innervation, and electrical properties. J. Gen.

Physiol. 75, 79-105. 

Holstien, K., Rivera, A., Windsor, P., Ding, S., Leys, S. P., Hill, M. and Hill, A.

(2010). Expansion, diversification, and expression of T-box family genes in Porifera.

Dev. Genes Evol. 220, 251-262. 

Ijima, I. (1904). Studies on the Hexactinellida. Contribution IV. (Rossellidae). J. Coll.

Sci. Imp. Univ. Tokyo 28, 13-307. 

Jackson, D., Leys, S. P., Hinman, V. F., Woods, R., Lavin, M. F. and Degnan, B. M.

(2002). Ecological regulation of development: induction of marine invertebrate

metamorphosis. Int. J. Dev. Biol. 46, 679-686.

Kahn, A. and Leys, S. P. (2013).  Demosponges in Disguise: Formation of new

Syncytia in Glass Sponges. Conference presentation, World Sponge Conference,

Freemantle, WA, Australia.

Lawn, I. D., Mackie, G. O. and Silver, G. (1981). Conduction system in a sponge.

Science 211, 1169-1171. 

Leininger, S., Adamski, M., Bergum, B., Guder, C., Liu, J., Laplante, M., Bråte, J.,

Hoffmann, F., Fortunato, S., Jordal, S. et al. (2014). Developmental gene

expression provides clues to relationships between sponge and eumetazoan body

plans. Nat. Commun. 5, 3905. 

Lenton, T. M., Boyle, R. A., Poulton, S. W., Shields-Zhou, G. A. and Butterfield, N.

J. (2014). Co-evolution of eukaryotes and ocean oxygenation in the Neoproterozoic

era. Nat. Geosci. 7, 257-265. 

Lentz, T. L. (1966). Histochemical localization of neurohumors in a sponge. J. Exp.

Zool. 162, 171-179.

Lethias, C., Garrone, R. and Mazzorana, M. (1983). Fine structures of sponge cell

membranes: comparative study with freeze-fracture and conventional thin section

methods. Tissue Cell 15, 523-535. 

Leys, S. P. (1995). Cytoskeletal architecture and organelle transport in giant syncytia

formed by fusion of hexactinellid sponge tissues. Biol. Bull. 188, 241-254. 

Leys, S. P. (1999). The choanosome of hexactinellid sponges. Invertebr. Biol. 118,

221-235. 

Leys, S. P. and Degnan, B. M. (2001). Cytological basis of photoresponsive behavior

in a sponge larva. Biol. Bull. 201, 323-338. 

Leys, S. P. and Degnan, B. M. (2002). Embryogenesis and metamorphosis in a

haplosclerid demosponge: gastrulation and transdifferentiation of larval ciliated cells

to choanocytes. Invertebr. Biol. 121, 171-189. 

Leys, S. P. and Mackie, G. O. (1997). Electrical recording from a glass sponge. Nature

387, 29-30. 

Leys, S. P. and Meech, R. W. (2006). Physiology of coordination in sponges. Can. J.

Zool. 84, 288-306. 

Leys, S. P. and Reiswig, H. M. (1998). Nutrient transport pathways in the neotropical

sponge Aplysina. Biol. Bull. 195, 30-42.

Leys, S. P., Mackie, G. O. and Meech, R. W. (1999). Impulse conduction in a sponge.

J. Exp. Biol. 202, 1139-1150.

Leys, S. P., Cronin, T. W., Degnan, B. M. and Marshall, J. N. (2002). Spectral

sensitivity in a sponge larva. J. Comp. Physiol. A 188, 199-202. 

Leys, S. P., Cheung, E. and Boury-Esnault, N. (2006). Embryogenesis in the glass

sponge  Oopsacas minuta: Formation of syncytia by fusion of blastomeres. Integr.

Comp. Biol. 46, 104-117. 

Leys, S. P., Nichols, S. A. and Adams, E. D. M. (2009). Epithelia and integration in

sponges. Integr. Comp. Biol. 49, 167-177. 

Leys, S. P., Yahel, G., Reidenbach, M. A., Tunnicliffe, V., Shavit, U. and Reiswig, H.

M. (2011). The sponge pump: the role of current induced flow in the design of the

sponge body plan. PLoS ONE 6, e27787. 

Loewenstein, W. R. (1967). On the genesis of cellular communication. Dev. Biol. 15,

503-520. 

Ludeman, D. A., Farrar, N., Riesgo, A., Paps, J. and Leys, S. P. (2014). Evolutionary

origins of sensation in metazoans: functional evidence for a new sensory organ in

sponges. BMC Evol. Biol. 14, 3. 

Mackie, G. O. (1965). Conduction in the nerve-free epithelia of siphonophores. Am.

Zool. 5, 439-453.

Mackie, G. O. (1970). Neuroid conduction and the evolution of conducting tissues. Q.

Rev. Biol. 45, 319-332. 

Mackie, G. O. (1979). Is there a conduction system in sponges? Colloq. Int. CNRS

291, 145-151.

Mackie, G. O. (1990). The elementary nervous system revisited. Am. Zool. 30, 907-

920.

Mackie, G. O. (2004). Epithelial conduction: recent findings, old questions, and where

do we go from here? Hydrobiologia 530-531, 73-80. 

Mackie, G. O. and Singla, C. L. (1983). Studies on hexactinellid sponges. I Histology

of Rhabdocalyptus dawsoni (Lambe, 1873). Philos. Trans. R. Soc. B 301, 365-400. 

Mah, J. L., Christensen-Dalsgaard, K. K. and Leys, S. P. (2014). Choanoflagellate

and choanocyte collar-flagellar systems and the assumption of homology. Evol. Dev.

16, 25-37. 

Maldonado, M. and Bergquist, P. R. (2002). Phylum porifera. In Atlas of Marine

Invertebrate Larvae (ed. C. M. Young, M. A. Sewell and M. E. Rice), pp. 21-50. San

Diego, CA: Academic Press.

Maldonado, M., Durfort, M., McCarthy, D. A. and Young, C. M. (2003). The cellular

basis of photobehavior in the tufted parenchymella larva of demosponges. Mar. Biol.

143, 427-441. 

Maldonado, M., Ribes, M. and van Duyl, F. C. (2012). Nutrient fluxes through

sponges: biology, budgets, and ecological implications. Adv. Mar. Biol. 62, 113-182.

Maloof, A. C., Rose, C. V., Beach, R., Samuels, B. M., Calmet, C. C., Erwin, D. H.,

Poirier, G. R., Yao, N. and Simons, F. J. (2010). Possible animal-body fossils in

pre-Marinoan limestones from South Australia. Nat. Geosci. 3, 653-659. 

McNair, G. T. (1923). Motor reactions of the fresh-water sponge Ephydatia fluviatilis.

Biol. Bull. 44, 153-166. 

Mehl, D. (1996). Phylogenie und evolutionsökologie der hexactinellida (Porifera) im

paläozoikum. Geologische-Paläontologische Mitteilungen Innsbrück 4, 1-55.

Meixner, M. J., Lüter, C., Eckert, C., Itskovich, V., Janussen, D., von Rintelen, T.,

Bohne, A. V., Meixner, J. M. and Hess, W. R. (2007). Phylogenetic analysis of

freshwater sponges provide evidence for endemism and radiation in ancient lakes.

Mol. Phylogenet. Evol. 45, 875-886. 

Mohri, K., Nakatsukasa, M., Masuda, Y., Agata, K. and Funayama, N. (2008).

Toward understanding the morphogenesis of siliceous spicules in freshwater

sponge: differential mRNA expression of spicule-type-specific silicatein genes in

Ephydatia fluviatilis. Dev. Dyn. 237, 3024-3039. 

Moroz, L. L. (2009). On the independent origins of complex brains and neurons. Brain

Behav. Evol. 74, 177-190. 

Moroz, L. L., Kocot, K. M., Citarella, M. R., Dosung, S., Norekian, T. P.,

Povolotskaya, I. S., Grigorenko, A. P., Dailey, C., Berezikov, E., Buckley, K. M. et

al. (2014). The ctenophore genome and the evolutionary origins of neural systems.

Nature 510, 109-114. 

Moss, A. G. and Tamm, S. L. (1987). A calcium regenerative potential controlling

ciliary reversal is propagated along the length of ctenophore comb plates. Proc. Natl.

Acad. Sci. USA 84, 6476-6480. 

Mukai, H. (1989). Growth and reproduction of four species of freshwater sponge

cultured in their natural surroundings. Sci. Rep. Fac. Educ. Gunma Univ. 38, 25-

47.

Mukai, H. (1990). Further studies on growth and sex differentiation in four species of

freshwater sponges. Sci. Rep. Fac. Educ. Gunma Univ. 39, 41-56.

Müller, W. E. G., Wang, X., Binder, M., von Lintig, J., Wiens, M. and Schröder, H.

C.  (2012). Differential expression of the demosponge (Suberites domuncula)

carotenoid oxygenases in response to light: protection mechanism against the self-

produced toxic protein (Suberitine). Mar. Drugs, 10, 177-199. 

Nickel, M. (2001).  Cell Biology and Biotechnology of Marine Invertebrates. Sponges

(Porifera) as Model Organisms. PhD thesis, Stuttgart University, Stuttgart, Germany. 

Nickel, M. (2004). Kinetics and rhythm of body contractions in the sponge Tethya

wilhelma (Porifera: Demospongiae). J. Exp. Biol. 207, 4515-4524. 

Nickel, M. (2010). Evolutionary emergence of synaptic nervous systems: what can we

learn from the non-synaptic, nerveless Porifera? Invertebr. Biol. 129, 1-16. 

Nickel, M., Scheer, C., Hammel, J. U., Herzen, J. and Beckmann, F. (2011). The

contractile sponge epithelium sensu lato – body contraction of the demosponge

Tethya wilhelma is mediated by the pinacoderm. J. Exp. Biol. 214, 1692-1698. 

Nikko, E., Van de Vyver, G. and Richelle-Maurer, E. (2001). Retinoic acid down-

regulates the expression of EmH-3 homeobox-containing gene in the freshwater

sponge Ephydatia muelleri. Mech. Ageing Dev. 122, 779-794. 

Ou, H. C., Cunningham, L. L., Francis, S. P., Brandon, C. S., Simon, J. A., Raible,

D. W. and Rubel, E. W. (2009). Identification of FDA-approved drugs and bioactives

that protect hair cells in the zebrafish (Danio rerio) lateral line and mouse (Mus

musculus) utricle. J. Assoc. Res. Otolaryngol. 10, 191-203. 

Parker, G. (1919).  The Elementary Nervous System. Philadelphia, PA: JB Lippincott

Company.

Pavans de Ceccatty, M., Thiney, Y. and Garrone, R. (1970). Les bases

ultrastructurales des communications intercellulaires dans les oscules de quelques

REVIEW

The Journal of Experimental Biology (2015) doi:10.1242/jeb.110817

---