Comparative genetic mapping of allotetraploid cotton and its diploid progenitors

Edwards, G.A., and Endrizzi, J.E. 1975. Cell size, nuclear size and

DNA content relationships in Gossypium. Can. J. Genet. Cytol.

17: 181–186.

Edwards, G.A. Endrizzi, J.E., and Stein, R. 1974. Genome DNA

content

and

chromosome

organization

in

Gossypium.

Chromosoma, 47: 309–326.

Edwards, G.A., and Mirza, M.A. 1979. Genomes of the Australian

wild species of cotton. II. The designation of a new G genome

for Gossypium bickii. Can. J. Genet. Cytol. 21: 367–372.

Endrizzi, J.E. 1962. The diploid-like cytological behavior of

tetraploid cotton. Evolution, 16: 325–329.

Endrizzi, J.E., and Phillips, L.L. 1960. A hybrid between

Gossypium arboreum L., and G. raimondii Ulb. Can. J. Genet.

Cytol. 2: 311–319.

Endrizzi, J.E., Turcotte, E.L., and Kohel, R.J. 1985. Genetics, cy-

tology, and evolution of Gossypium. Adv. Genetics, 23: 271–

375.

Feldman, M., Liu, B., Segal, G., Abbo, S., Levy, A.A., and Vega,

J.M. 1997. Rapid elimination of low-copy DNA sequences in

polyploid wheat: A possible mechanism for differentiation of

homoeologous chromosomes. Genetics, 147: 1381–1387.

Fryxell, P.A. 1979. The natural history of the cotton tribe. Texas

A&M University Press, College Station, Texas.

Fryxell, P.A. 1992. A revised taxonomic interpretation of

Gossypium L. (Malvaceae). Rheedea, 2: 108–165.

Gerstel, D.U. 1953. Chromosomal translocations in interspecific

hybrids of the genus Gossypium. Evolution, 7: 234–244.

Gerstel, D.U., and Sarvella, P.A. 1956. Additional observations on

chromosomal translocations in cotton hybrids. Evolution, 10:

408–414

Gomez, M., Johnston, J.S., Ellison, J.R., and Price, H.J. 1993. Nu-

clear 2C DNA content of Gossypium hirsutum L. accessions de-

termined by flow cytometry. Biol. Zentralbl. 112: 351–357.

Grant, V. 1981. Plant speciation. Columbia University Press, New

York.

Haldane, J.B.S. 1919. The combination of linkage values, and the

calculation of distances between the loci of linked factors. J.

Genet. 8: 299–309.

Helentjaris, T., Weber, D.F., and Wright, S. 1988. Identification of

the genomic locations of duplicate nucleotide sequences in

maize by analysis of restiction fragment length polymorphisms.

Genetics, 118: 353–363.

Kadir, Z.B.A. 1976. DNA evolution in the genus Gossypium.

Chromosoma, 56: 85–94.

Kianian, S.F., and Quiros, C.F. 1992. Generation of a Brassica

oleracea composite RFLP map: Linkage arrangements among

various populations and evolutionary implications. Theor. Appl.

Genet. 84: 544–554.

Kimber, G. 1961. Basis of the diploid-like meiotic behavior of

polyploid cotton. Nature, 191: 99–100.

Kowalski, S.P., Lan, T.-H., Feldmann, K.A., and Paterson, A.H.

1994. Comparative mapping of Arabidopsis thaliana and Bras-

sica oleracea chromosomes reveals islands of conserved organi-

zation. Genetics, 138: 499–510.

Lagercrantz, U., and Lydiate, D.J. 1996. Comparative genome

mapping in Brassica. Genetics, 144: 1903–1910.

Lander, E.S., Green, P., Abrahamson, J., Barlow, A., Daly, M.J.,

Lincoln, S.E., and Newberg, L. 1987.

MAPMAKER

: An interactive

computer package for constructing primary genetic linkage

maps of experimental and natural populations. Genomics, 1:

174–181.

Leipoldt, M., and Schmidtke, J. 1982. Gene expression in phylo-

genetically polyploid organisms. In Genome evolution. Edited

by G.A. Dover and R.B. Flavell. Academic Press, London.

pp. 219–236.

Leitch, I.J., and Bennett, M.D. 1997. Polyploidy in angiosperms.

Trends Plant Sci. 12: 470–476.

Lewis, W.H. (ed.). 1980. Polyploidy: Biological relevance. Plenum

Press, New York.

Liu, B., Vega, J.M., Segal, G., Abbo, S., Rodova, M., and

Feldman, M. 1998. Rapid genomic changes in newly synthe-

sized amphiploids of Triticum and Aegilops. I. Changes in low-

copy non-coding DNA sequences. Theor. Appl. Genet. In press.

Lydiate, D., Sharpe, A., Lagercrantz, U., and Parkin, I. 1993. Map-

ping the Brassica genome. Outlook Agric. 22: 85–92.

Masterson, J. 1994. Stomatal size in fossil plants: Evidence for

polyploidy in majority of angiosperms. Science, 264: 421–424.

Menzel, M.Y., and Brown, M.S. 1954. The significance of

multivalent formation in three-species Gossypium hybrids. Ge-

netics, 39: 546–557.

Menzel, M.Y., Hasenkampf, C.A., and Stewart, J.McD. 1982. In-

cipient genome differentiation in Gossypium. III. Comparison of

chromosomes of G. hirsutum and Asiatic diploids using hetero-

zygous translocations. Genetics, 100: 89–103.

Michaelson, M.J., Price, H.J., Ellison, J.R., and Johnston, J.S.

1991. Comparison of plant DNA contents determined by

Feulgen microspectrophotometry and laser flow cytometry. Am.

J. Bot. 78: 183–188.

Moore, G., Aragonalcaide, L., Roberts, M., Reader, S., Miller, T.,

and Foote, T. 1997. Are rice chromosomes components of a

holocentric chromosome ancestor? Plant Mol. Biol. 35: 17–23.

Moore, G., Devos, K.M., Wang, Z., and Gale, M.D. 1995. Grasses,

line up and form a circle. Curr. Biol. 5: 737–739.

Mursal, I. El J., and Endrizzi, J.E. 1976. A reexamination of the

diploidlike meiotic behavior of polyploid cotton. Theor. Appl.

Genet. 47: 171–178.

Parkin, I.A.P., Sharpe, A.G., Keith, D.J., and Lydiate, D.J. 1995.

Identification of the A and C genomes of amphidiploid Brassica

napus (oilseed rape). Genome, 38: 1122–1131.

Paterson, A.H., Brubaker, C.L., and Wendel, J.F. 1993. A rapid

method for extraction of cotton (Gossypium spp.) genomic DNA

suitable for RFLP or PCR analysis. Plant Mol. Biol. Rep. 11:

122–127.

Paterson, A.H., Lan, T.-H., Reischmann, K.P., Chang, C., Lin, Y.-

R., Liu, S.-C., Burow, M.D., Kowalski, S.P., Katsar, C.S.,

DelMonte, T.A., Feldmann, K.A., Schertz, K.F., and Wendel,

J.F. 1996. Toward a unified genetic map of higher plants, tran-

scending the monocot-dicot divergence. Nature Genet. 14: 380–382.

Pereira, M.G., Lee, M., Bramel-Cox, P., Woodman, W., Doebley,

J., and Whitkus, R. 1994. Construction of an RFLP map in sor-

ghum and comparative mapping in maize. Genome, 37: 236–243.

Phillips, L.L., and Strickland, M.A. 1966. The cytology of a hybrid

between Gossypium hirsutum and G. longicalyx. Can. J. Genet.

Cytol. 8: 91–95.

Quiros, C.F., Hu, J., and Truco, M.J. 1994. DNA-based marker

maps of Brassica. In DNA-based markers in plants. Edited by

R.L. Phillips and I.K. Vasil. Kluwer Academic Publishers,

Dordrecht. pp. 199–222.

Reinisch, A.J., Dong, J.-M., Brubaker, C.L., Stelly, D.M., Wendel,

J. F., and Paterson, A.H. 1994. A detailed RFLP map of cotton,

Gossypium hirsutum × Gossypium barbadense: Chromosome or-

ganization and evolution in a disomic polyploid genome. Genet-

ics, 138: 829–847.

Seelanan, T., Schnabel, A., and Wendel, J.F, 1997. Congruence and

consensus in the cotton tribe. Syst. Bot. 22: 259–290.

© 1999 NRC Canada

202

Genome Vol. 42, 1999

---

© 1999 NRC Canada

Brubaker et al.

203

Sharpe, A.G., Parkin, I.A.P., Keith, D.J., and Lydiate, D.J. 1995.

Frequent nonreciprocal translocations in the amphidiploid

genome of oilseed rape (Brassica napus). Genome, 38: 1112–1121.

Sidow, A. 1996. Genome duplications in the evolution of early ver-

tebrates. Curr. Opin. Genet. Dev. 6: 715–722.

Skovsted, A. 1934. Cytological studies in cotton. II. Two

interspecific hybrids between Asiatic and New World cottons. J.

Genet. 28: 407–424.

Skovsted, A. 1937. Cytological studies in cotton. IV. Chromosome

conjugation in interspecific hybrids. J. Genet. 34: 97–134.

Soltis, D.E., and Soltis, P.S. 1993. Molecular data and the dynamic

nature of polyploidy. Cri. Rev. Plant Sci. 12: 243–273.

Song, K., Lu, P., Tang, K., and Osborn, T.C. 1995. Rapid genome

change in synthetic polyploids of Brassica and its implications

for polyploid evolution. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 92: 7719–7723.

Spring, J. 1997. Vertebrate evolution by interspecific hybridization

- are we polyploid? FEBS Lett. 400: 2–8.

Stebbins, G.L. 1950. Variation and evolution in plants. Columbia

University Press, New York.

Stebbins, G.L. 1971. Chromosomal evolution in higher plants. Ed-

ward Arnold, London.

Stewart, J.McD. 1994. Potential for crop improvement with exotic

germplasm and genetic engineering. In Challenging the future:

Proceedings of the world cotton research conference-1, Bris-

bane, Australia, February 14–17. Edited by G.A. Constable and

N.W. Forrester. CSIRO, Melbourne. pp. 313–327

Suiter, K.A., Wendel, J.F., and Case, J.S. 1983.

LINKAGE-1

:

A PASCAL

computer program for the detection and analysis of genetic link-

age. J. Hered. 74: 203–204.

Tanksley, S.D., Bernatzky, R., Lapitan, N.L., and Prince, J.P. 1988.

Conservation of gene repertoire but not gene order in pepper

and tomato. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 6419–6423.

Tanksley, S.D., Ganal, M.W., Prince, J.P., de Vicente, M.C.,

Bonierbale, M.W., Broun, P., Fulton, T.M., Giovannoni, J.J.,

Grandillo, S., Martin, G.B., Messeguer, R., Miller, J.C., Miller,

L., Paterson, A.H., Pineda, O., Röder, M.S., Wing, R.A., Wu,

W., and Young, N.D. 1992. High density molecular linkage

maps of the tomato and potato genomes. Genetics, 132: 1141–1160.

Wendel, J.F. 1989. New World tetraploid cottons contain Old

World cytoplasm. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 4132–4136.

Wendel, J.F., and Albert, V.A. 1992. Phylogenetics of the cotton

genus (Gossypium): Character-state weighted parsimony analy-

sis of chloroplast-DNA restriction site data and its systematic

and biogeographic implications. Syst. Bot. 17: 115–143.

Wendel, J.F., Olson, P.D., and Stewart, J.McD. 1989. Genetic di-

versity, introgression, and independent domestication of Old

World cultivated cottons. Am. J. Bot. 76: 1795–1806.

Whitkus, R., Doebley, J., and Lee, M. 1992. Comparative genome

mapping of sorghum and maize. Genetics, 132: 1119–1130.

Wolfe, K.H., and Shields, D.C. 1997. Molecular evidence for an

ancient duplication of the entire yeast genome. Nature, 387:

708–713.

Zhao, X., Wing, R., Paterson, A.H. 1996. Cloning and character-

ization of the majority of repetitive element families in cotton

(Gossypium L.). Genome, 38: 1177–1188.