Curriculum Vitae of Giovanni Parmigiani

[252] Parmigiani G, Ancukiewicz M, Matchar DB.

Decision models in clinical recommendations develop-

ment: the Stroke Prevention Policy Model

. In: Berry DA, Stangl DK, eds., Bayesian Biostatistics,

vol. 151 of Statistics: Textbooks and Monographs, 207–233. New York: Marcel Dekker 1996.

[253] Clyde MA, M¨

uller P, Parmigiani G.

Inference and design strategies for a hierarchical logistic

regression model

. In: Berry DA, Stangl DK, eds., Bayesian Biostatistics, vol. 151 of Statistics:

Textbooks and Monographs, 297–320. New York: Marcel Dekker 1996.

[254] Carota C, Parmigiani G.

On Bayes factors for nonparametric alternatives

. In: Bernardo JM,

Berger JO, Dawid AP, Smith AFM, eds., Bayesian Statistics 5 – Proceedings of the Fifth Valencia

International Meeting, 507–511. Clarendon Press [Oxford University Press] 1996.

[255] Clyde MA, Parmigiani G.

Orthogonalizations and priors for orthogonalized model mixing

. In:

Lee JC, Johnson WO, Zellner A, eds., Modelling and Prediction: Honoring of Seymour Geisser,

206–227. New York: Springer 1996.

[256] Parmigiani G. Utility in health studies. In: Rosner B, Glynn R, eds., Encyclopedia of Biostatistics.

New York: Wiley 1998.

[257] Parmigiani G, Berry D, Iversen Jr ES, M¨

uller P, Schildkraut J, Winer E.

Modeling risk of breast

cancer and decisions about genetic testing

. In: Gatsonis C, et al., eds., Case Studies In Bayesian

Statistics, vol. IV, 173–268. Springer 1998.

[258] Iversen Jr ES, Parmigiani G, Berry D.

Validating Bayesian prediction models: a case study in

genetic susceptibility to breast cancer

. In: Gatsonis C, Kass RE, Carlin B, Carriquiry A, Gelman

A, Verdinelli I, West M, eds., Case Studies In Bayesian Statistics, vol. IV, 321–338. NY: Springer

1998.

[259] Parmigiani G.

Decision models in screening for breast cancer

. In: Bernardo JM, Berger JO, Dawid

AP, Smith AFM, eds., Bayesian Statistics 6, 525–546. Oxford: Oxford University Press 1999.

[260] Dominici F, Parmigiani G. Combining studies with continuous and dichotomous responses: a

latent variables approach. In: Stangl DK, Berry DA, eds., Meta–analysis in Medicine and Health

Policy, vol. 151, 105–126. New York, NY, USA: Marcel Dekker 2000.

[261] Parmigiani G. Decision theory: Bayesian. In: Smelser N, Baltes P, eds., International Encyclopedia

of Social and Behavioral Sciences, 3327–3334. Oxford: Elsevier 2001.

[262] Parmigiani G, Garrett ES, Irizarry RA, Zeger SL. The analysis of gene expression data: an overview

of methods and software. In: Parmigiani G, Garrett ES, Irizarry RA, Zeger SL, eds., The analysis

of gene expression data: methods and software, 1–45. New York: Springer 2003.

[263] Garrett ES, Parmigiani G. POE: Statistical tools for molecular profiling. In: Parmigiani G, Garrett

ES, Irizarry RA, Zeger SL, eds., The analysis of gene expression data: methods and software,

362–387. New York: Springer 2003.

[264] Parmigiani G, Garrett E, Azbazhagan B, Gabrielson E. Molecular classification of lung cancer - a

cross-platform comparison of gene epxression data sets. Chest 125(5); 103S 2004.

[265] Garrett ES, Parmigiani G.

Clustering and classification methods for gene expression data analysis

.

In: Nuber U, ed., DNA Microarrays: Advanced Methods, 241–256. New York: Taylor and Francis

2005.

23

---

[266] Shen Y, Parmigiani G. Optimization of breast cancer screening modalities. In: Nikoulina, Com-

menges, Huber, eds., Probability, Statistics and Modeling in Public Health, 405–420. New York:

Springer 2006.

[267] M¨

uller P, Parmigiani G, Rice K.

FDR and Bayesian multiple comparisons rules

. In: Bernardo JM,

Bayarri S, Berger JO, Dawid A, Heckerman D, Smith AFM, West M, eds., Bayesian Statistics 8.

Oxford University Press 2007.

[268] Parmigiani G, Blackford A. Familial cancer risk assessment using BayesMendel. In: Casagrande

J, Davuluri R, Ochs M, eds., Biomedical Informatics for Cancer Research. Springer 2010.

[269] Zhong X, Marchionni L, Cope L, Iversen ES, Garrett-Mayer ES, Gabrielson E, Parmigiani G. Op-

timized cross-study analysis of microarray-based predictors. In: Do KA, Qin S, Vannucci M, eds.,

Advances in Statistical Bioinformatics: Models and Integrative Inference for High-Throughput

Data, 398. Cambridge University Press 2013.

[270] Parmigiani G, Boca S, Ding J, Trippa L. Gene Function Analysis, Methods in Molecular Biology,

chap. Statistical Tools and R Software for Cancer Driver Probabilities, 113–134. Humana Press

2014.

[271] Tyekucheva S, Parmigiani G. Bioinformatic analysis of epidemiological and pathological data. In:

Loda M, Mucci L, Mittelstadt ML, Hemelrijck MV, Cotter MB, eds., Pathology and Epidemiology

of Cancer, 91–105. Springer 2016.

Book Reviews Comments and Responses

[272] Parmigiani G.

Review of “Scientific reasoning: The Bayesian approach”

. Journal of the American

Statistical Association 86; 825–827 1991.

[273] Parmigiani G.

Review of “Large deviation techniques in decision, simulation and estimation”

.

Technometrics 34; 120–121 1992.

[274] Parmigiani G. Comment on “Several Bayesians: A review”. Test Madrid 2; 24–25 1993.

[275] Clyde M, DeSimone H, G. P. Comment on: Accounting for model uncertainty in survival analysis

improves predictive performance, by Raftery et al. In: Bernardo JM, Berger JO, Dawid AP,

Smith AFM, eds., Bayesian Statistics 5 – Proceedings of the Fifth Valencia International Meeting,

323–349. Clarendon Press [Oxford University Press] 1996.

[276] Berry DA, Parmigiani G.

Response to: Re: probability of carrying a mutation of breast-ovarian

cancer gene BRCA1 based on family history by Schaid, dj

. J Natl Cancer Inst 89; 1634 1997.

[277] Berry D, Parmigiani G, Rubinstein W, Watson P.

Response to Nonovarian Pelvic Cancers in

BRCA1/2 Mutation Carriers and the BRCAPRO Statistical Model by Cremin et al.

J Clin Oncol

20; 3936–3937 2002.

[278] Chen S, Iversen ESJ, Parmigiani G.

In Reply to: BRCA1 and BRCA2 Cancer Risks by Antoniou

et al

. J Clin Oncol 24; 3313–3314 2006.

[279] Parmigiani G, Chen S.

In Reply to: One Risk Fits All? by De Bock et al.

J Clin Oncol 25; 3384–

2007.

24

---