Curriculum Vitae of Giovanni Parmigiani

FUNDING

Training fellowship

1. Manca Fellowship for Research and Teaching at Universit`

a L. Bocconi, Milano, 1984–85 and

1985–86.

Funding at Duke

AS PRINCIPAL INVESTIGATOR OR PROJECT LEADER:

2

2. NSF DMS-94 03818 (PI). “Bayesian Methods and Decisions for Observation Times.” From 6-94

to 12-97.

3. NIH-NCI P20-CA66228-01 (PL). “Decision Models for Breast Cancer Screening.” Pilot Project

within “Planning a Program of Research in Early Breast Cancer” (PI: B. Rimer). From 6-94 to

6-95.

4. NSF DMS-95 0519 (PI). ”Workshop on Model Uncertainty and Model Robustness” From 7-95 to

7-96.

5. NIH-NCI 95-018 (Co-PL). “Modeling Risk of Breast Cancer.” Developmental Project within the

Duke CPRU (P.I.: B. Rimer). From 6-96 to 6-98.

6. NIH-NCI R21-CA68438-01 (Co-PL). “Decision Models in Breast Cancer.” Developmental project

within the Duke SPORE in Breast Cancer (PI: D. Iglehart). From 7-96 to 7-97.

7. NIH-NCI (Co-PL). “Models for Assessing Risk of Familial Breast and Ovarian Cancer.” Develop-

mental project within the Duke SPORE in Breast Cancer (PI: D. Iglehart). From 7-97 to 7-98.

8. NSF DMS: (PI) “Workshop on stochastic model building and variable selection,” From 7-97 to

7-98.

9. NIH-NCI (Co-PL in year 1, PL in year 2) “Modeling BRCA1&2 carrier probabilities.” Project 4

within the Duke SPORE in Breast Cancer renewal application (PI: D. Iglehart). $180432 requested

for Project 4. From 7-98 to 7-00.

10. NIH-NCI (Co-PL). “Tamoxifen for prevention of breast cancer in genetically susceptible women.”

Developmental project within the Duke SPORE in Breast Cancer (PI: D. Iglehart). From 7-98 to

7-99.

11. NIH-NCI 95-018 (PL). “External Validation of the CPRU Breast Cancer Risk Prediction Model.”

Developmental Project within the Duke CPRU (P.I.: I. Siegler). From 6-98 to 6-99.

AS INVESTIGATOR:

12. NSF DMS-93-05699. “Mathematical Sciences Computing Resource Environments.” From 6-93 to

11-95.

13. NIH-NCI 1P50-CA68438-01. “Interventions in Breast Cancer: A Decision Model.” Project 4

within the Duke SPORE in Breast Cancer (PI: D. Iglehart). From 7-95 to 7-96.

14. NIH-NCI Cancer Genetics Networks. (P.I. D. Iglehart)

15. DuPont Merck. “A randomized trial of anticoagulation services for stroke prevention”. 11-98 to

11-99.

2

PI: Principal investigator; PL: Project leader; CL: Core leader

27

---

AS SPONSOR OF GRADUATE STUDENTS:

16. Duke University, Arts and Sciences Research Council seed grants.

1992 (PI), 1993 (co-PI), 1994 (co-PI), 1995 (co-PI), 1996 (PI), 1998 (PI).

17. Becton Dickinson Research Center. Graduate student internship grant 1997/98 and 1998/99

18. Janssen Research Foundation. “A User-friendly Acute Stroke Treatment Model for Lubeluzole”.

(PI: D. Matchar) From 10-97 to 10-99.

19. Knoll Pharmaceuticals. From 9-99 to 8-00.

Funding at Johns Hopkins

AS PRINCIPAL INVESTIGATOR OR PROJECT/CORE LEADER:

3

20. NIH-NCI “Biostatistics and Bioinformatics Core” (CL) within the “Johns Hopkins SPORE in Breast

Cancer”(SPORE PI: Davidson). From 00 to 12.

21. NIH-NIDDK “Biostatistics Core” (CL) within the “The Hopkins DK Center for the Analysis of

Gene Expression” (Center PI Germino). From 00 to 03.

22. NIH-NCI Cancer Genetics Networks. (PL) “Validation of BRCA1&2 Carrier Probability Models”

(Center PI Griffin). From 01 to 02.

23. CRFA (PI) “Risk Prediction in Familial Colon Cancer”. From 01 to 03.

24. NIH-NCI P50 (PI) “Susceptibility Prediction in Familial Colon Cancer”. Project 3a of “Johns

Hopkins SPORE in Gastrointestinal Cancer” (SPORE PI: Kern). From 02 to 07.

25. NSF (PI) “Multi-study genomic data analysis”. From 04 to 09.

26. NIH-NCI R01 (PI) “Statistical Methods for Cancer Genes”. From 04 to 08.

27. NIH-NCI “Sidney Kimmel Cancer Center Bioinformatics Shared Resource” (CL) within the “Re-

gional Oncology Research Center” (PI: Abeloff). From 06 to 11.

28. NIH-NIGMS “Pre-doctoral biostatistical training in genetics/genomics” 1T32 GM074906-01A1/B7BSCW.

From 06 to 10.

29. Komen Foundation “Improvement and Validation of BRCAPRO”, from 08 to 11.

AS INVESTIGATOR:

30. NIH-NCI “Regional Oncology research center” (PI’s: Abeloff, Baylin). From 99 to 11.

31. NIH-NCI “Johns Hopkins SPORE in Gastrointestinal Cancer” Biostatistics core (PI: Kern, CL:

Goodman). From 99 to 11.

32. NIH-NCI “High throughput genetic analysis of bladder cancer” (PI Schoenberg). From 99 to 00.

33. NIH “Applied Genomics in Cardiopulmonary Disease” (PI: Garcia). From 00 to 02.

34. ACS “Molecular Genetic Alterations in Germ Cell Tumors” (PI Perlman) From 00 to 01

35. ACS “Genetic Analysis of Pediatric Germ Cell Tumors” (PI Perlman) From 01 to 01

36. NIH-NCI “Molecular epidemiology of progression to breast cancer” (PI: Helzlsour). Project 1

within the “Johns Hopkins SPORE in Breast Cancer”. From 00 to 05.

37. NIH-NCI “Molecular classification of breast cancer” (PI: Gabrielson). Project 3 within the “Johns

Hopkins SPORE in Breast Cancer”. From 00 to 05.

38. NIH-NCI-EDRN “Evaluating Biomarkers of Carcinogenesis” (PI: Helzlsour). From 00 to 03.

3

PI: Principal investigator; PL: Project leader; CL: Core leader

28

---

39. Broad Foundation “Classification of Crohn’s disease subtypes by gene expression profiles” (PI

Chakravarti). From 03 to 04.

40. NIH-NIDDK R01 “Consequences of Lifetime Isolated GH Deficiency” (PI: Salvatori). From 04 to

08.

41. NIH-NCI “Phase II Imaging & Localizong Device the Barkhausen Effect” (PI: Dicello). From 06

to 08.

42. Lustgarden Foundation “Pancreatic Cancer Genome Sequencing” (PI: Vogelstein). From 07 to 09.

43. NIH-NCI “Institute for Clinical and Translational Research” (PI: Ford) 07 to 12.

44. NIH-NCI “Tools for Large-Scale Analysis of Driver Pathways” (PI: Karchin) 08 to 10.

AS CONSULTANT or MENTOR:

45. NIH “cDNA Microarrays in the Differential Diagnosis of Suspicious Thyroid Lesions” (PI: Zeiger).

From 7/99 to 11/03.

46. NIH “Regulation of RHODOPSIN Gene Expression” (PI: Zack).

47. NLM “Johns Hopkins Health Sciences Informatics Training Program” (PI: Lehmann).

48. Fogarty International Center “International Collaborative Genetics Research Training Program”

(PI: Jabs).

49. NIH-NIMH K01 “Bioinformatics for Gene Discovery in Psychiatric Disorders” (PI: Zandi)

50. NIH-NIAID K01 “Mutation profile analysis of HIV genetic heterogeneity” (PI: Kowalski)

Funding at Harvard

AS PRINCIPAL INVESTIGATOR OR PROJECT/CORE LEADER:

4

51. NIH/NCI (PI), ”Statistical Methods for Cancer Susceptibility Genes”. From 04 to 10.

52. Susan G Komen Breast Cancer Foundation (PI), ”Improvement and Validation of BRCAPRO”.

From 08 to 10.

53. NSF (PI) “Multi-study genomic data analysis”. From 09 to 11.

54. NIH (PL) ”Administrative Program Leaders-Parmigiani”. From 09 to present.

55. NIH (PL) ”Administrative Program Senior Leaders-Parmigiani”. From 09 to present.

56. NSF (PI) ”ADT: Quantitative Methods for Estimating Sequencing Errors”. From 12 to present.

57. NIH (PI) ”Biometry/Epidemiology Training Grant in Biostatistics”. From 13 to present.

58. NIH (PI) ”Bioinformatics Tools for Genomic Analysis of Tumor and Stromal Pathways in Cancer”.

From 13 to present.

59. NIH (PI) ”Novel Tools for Familial Risk Prediction”. From 13 to present.

AS INVESTIGATOR:

60. American Cancer Society, ”Refining Molecular Risk Assessment in the Familial Melanoma Popu-

lation” (PI: Hensin Tsao). From 09 to 10.

61. NIH, ”Genomic Stratification of Ovarian Cancer Patients” (PI: Michael Birrer). From 10 to 13.

62. Prostate Cancer Foundation, ”Shedding Light on Stromal-Epithelial Interactions in Prostate Car-

cinogenesis and Mortality”. From 12 to present.

4

PI: Principal investigator; PL: Project leader; CL: Core leader

29

---