Genomika tárgy 1



Yüklə 327,75 Kb.
səhifə2/5
tarix17.01.2018
ölçüsü327,75 Kb.
#21289
1   2   3   4   5

I. cikkelyAsztma





  1. Mi az allergia?

Az allergia immunológiai mechanizmus által indított túlérzékenységi reakció. Az allergián belül megkülönböztethetünk IgE által, és nem-IgE által mediált allergiát.

  1. Mi az atópia?

Az atópia az egyéni, vagy családi hajlam arra, hogy az egyén alacsony dózisú allergén, általában fehérjék hatására IgE ellenanyagot termeljen és olyan jellegzetes tüneteket mutasson mint az asztma, rhinoconjunctivitis, vagy az ekcéma/dermatitis.

  1. Mi az allergiás asztma?

Az immunológiai mechanizmusok által mediált asztmát allergiás asztmának definiálja.

  1. Mi jellemző az asztmára?

Asztma(Asthma bronchiale): krónikus légúti betegség. Jellemző a kis légutak epizódokban jelentkező gyulladása és szűkülete különböző triggerelő tényezőkre. Az asztma rohamok lehetnek enyhék és életveszélyesen súlyosak. Tünetei:légszomj, köhögés, zihálás, mellkasi fájdalom, és feszülés, valamint ezek kombinációi. A kiváltó okok lehetnek: allergének, fertőzés, fizikai munka, hirtelen éghajlatváltozás, légszennyezések, mint pl. cigarettafüst.

Két fázis: korai tünetek: 15-30 perccel, késői: 4-6 órával a provokáció (pl. antigén belélegzés) után.



  1. Mi az a tisztaság hipotézis?

tisztasághipotézis (Th1 trigger hipotézis) : a nyugati típusú társadalmakban nem engedjük, hogy a Th1 felé eltolódott immunválasz kialakuljon.

  1. Milyen sejtek játsszák az asztmában a legfontosabb szerepet?

CD4+ T helper sejtek (Th)

  1. Mi az a légúti hiperreaktivitás?

Légúti hiperreaktivitás (AHR= airway hyperresponsiveness, BHR = bronchial ...): az asztma egyik jellemzője. Túlérzékenység különböző stimulusokra, mint például: allergének, légszennyeződések, hideg levegő, fizikai munka, metakolin, hisztamin stb. A kiváltó ok megszüntetésével, vagy glükokortikoid hatására a fulladás megszűnik.Légúti hipereaktivitás mértéke különböző súlyosságú asztmás betegekben (metakolin (Mch) hatására spirométerrel)FEV1: forced expiratory volume 1s

  1. Milyen szerepe van az IL-4-nek az asztmában?

Th0 sejtek differenciálása Th2 sejtekké

B sejt átkapcsolása IgE termelésre

Endothel sejtek VCAM-1(vascular cell adhesion molecule) termelését erősíti (ez szükséges az eozinofilek szövetbe történő infiltrációjához)

Epithel sejtek eotaxin termelését fokozza: eozinofilek odavonzása

Hízósejt érés kofaktora


  1. Milyen szerepe van az IgE-nek asztmában?

Fontos szerep a hízósejtek aktiválásában, és az azonnali allergiás reakciókban. Két receptor: nagy affinitású: FceRI; kis affinitású: CD23 (FceRII)

Ag-specifikus IgE szenzitizált egereken AHR-t vált ki: FceRI KO egereken nem, CD23 KO-n igen

CD23 szerepe: B sejtek IgE termelését serkenti, APC tulajdonságát erősíti

T sejt hiányos egereken Ag-spec IgE nem okoz eozinofiliát és AHR-t. Ezeket IL-5-tel lehet visszaállítani.

B sejt hiányos egereken légúti Ag szenzitizálás T sejt aktiválást és Th2 citokin termelést és eozinofiliát okozott, de nem volt AHR. Szisztémás Ag szenzitizálásnál volt AHR is: IgE nem létfontosságú az asztmában


  1. Milyen tünetei vannak annak a transzgenikus egérnek, melynek IL-5 gént rakunk CC10 promótere után?

L-5 transzgenikus egérben (a tüdő epitél sejtekben, Clara cell 10 gén (CC10) promótere után) magas az eozinofilszám és súlyos asztma alakul ki.

  1. Hogyan lehet légúti hiperreaktivitást kiváltani IL-4 KO egéren?

OVA kezelés után nincs IgE, légúti eozinofilia, AHR

OVA spec. IgE adagolás: nincs légúti eozinofilia, AHR

IL-5 adagolás: légúti eozinofilia, AHR kialakul

Az IL-4 legfontosabb szerepe: szenzitizáláskor Th2 irányba tolja el az immunválaszt, elősegítve így az IL-5 termelést.

Egértörzsenként különböző eredmények: BALB/c IL-4 KO egerekben kialakulnak az asztmatikus tünetek (AHR) OVA hatására: más a patomechanizmus ebben az egértörzsben

-IL-13, IL-4R, STAT6 szerepe



  1. Milyen jellemzői vannak az IL-13 KO egérnek allergén szenzitizálás és provokáció után?

IL-13 KO egér (allergén szenzitizálás és provokálás után): csökkent eozinofilia, mucus, légúti gyulladás, AHR

  1. Mi lehet annak a magyarázata, hogy az IL-9 KO egereket ugyanúgy asztmásítani lehetett, mind a vad egereket?

Az IL-9 szerepét átvették más citokinek.

  1. Melyik a Th2-es válaszban kulcsfontosságú transzkripciós faktor?

GATA-3

  1. Mit okozott a T-bet kiütése egérben?

Az egereken spontán, a humán krónikus asztmához hasonló állapot alakult ki.

  1. Melyik transzkripciós faktor szintje emelkedik meg az asztmások tüdejében?

GATA-3

  1. Hogyan gátolhatjuk a GATA-3 működését asztmában?

Antisense GATA-3 (AS-GATA3) kezelés megszünteti egéren az OVA indukálta aszthmatikus tüneteket

AS-GATA3 kezelés: megszünteti a mucus termelést és a gyulladást



  1. Mit okozott a GATA-3 gátlása asztmás egér tüdejében?

Antisense GATA-3 (AS-GATA3) kezelés megszünteti egéren az OVA indukálta asztmatikus tüneteket

  1. Mi a hisztamin szerepe az allergiás megbetegedésekben?

Hízósejtek és a bazofilek termelik.

A hisztamin a korai asztmatikus reakció tünet- együttesének fontos mediátora.

Simaizom kontrakció, Érpermeabilitás, Vazodilatáció, Mucus szekréció

A plazma hisztamin koncentrációja korrelál az asztma súlyosságával.

H1 receptor antagonisták szerepe

Hisztidin dekarboxiláz: hisztamint szintetizál; HDC KO egér: nincs endogén hisztaminja



  1. Hogyan lehet QTL vizsgálatot végezni asztmában?

Példa QTL vizsgálatra egerekben:3 asztmára jellemző fenotípus (AHR, eozinofil szám, IgE szint összehasonlítása különböző egértörzseken melyeket ovalbuminnal illetve semleges pufferrel (kontroll állatok) kezeltek.

-A/J egerek: legmarkánsabb asztmatikus tünetek; C3H/HeJ: legrezisztensebb az asztmával szemben

-QTL tanulmányozása az A/J x (C3H/HeJ x A/J)F1 backcross egereken

-164 mikroszatellita marker, 10 cM felbontás.

-QT: AHR


  1. Milyen QT-kat lehet figyelni az asztmások genomszűrésénél?

3 LOD csúcsot detektáltak összesen:1: D2Mit359–D2Mit416 neve: Abhr1, LOD: 4,2; humán homológok: 10p11-13, 2q12-q14,9q22-q34: GATA-3, IL-1R antagonista 2: D2Mit238–D2Mit298 neve: Abhr2 LOD: 3.7, humán homológok: 9q33-q34, 2q14-q24: prostaglandin synthase 1 3: D7Mit21–D7Mit56 , LOD: 1,9, humán homológ: 19q13: IL-11

  1. Milyen, az asztmában jelentős gének vannak az 5q31-q33 kromoszómarégióban?

Citokin génklaszter: IL-4, IL-13, IL-3, IL-5, IL-9, GM-CSF, b-adrR-9 mut-as-csere-2 noct asthma gcR-, IL-4 között D5S436 asthma, CD14

  1. Milyen szerepe lehet a CD14-nek asztmában?

Szerepet játszik a T1/Th2 egyensúly kialakulásában

  1. Milyen, az allergiában fontos szerepet betöltő gének vannak a 6p21.3 kromoszómarégióban?

Az MHC tartomány: MHC II (HLA-D) allergénpeptidek prezentációja a “jobb” vagy “rosszabb” bemutatás más citokineket termelő Th sejtek aktivációját, tehát erősebb vagy gyengébb allergiás immunválaszt eredményez.

Parlagfű Amb5 allergénjére reagáló fehérek 97,5%-a: DR2.2; nem reagáló: 22% DR2.2; Amb6, Der1 (poratka allergénje) és a Der2-vel kapcsolatban is találtak hasonlókat.

TNFα: Gyulladási választ közvetítése → Asztma TNFα -308 G/A promóter polimorfizmus: az A allél magasabb expressziót és TNF α szinttel jár.


  1. Hogyan okozhatnak emelkedett asztma hajlamot az IL-4R-ban található Ile75Val (I50V) és Glu576Arg polimorfimus?

IL-4R: IL-4-nek (és az α alegység az IL-13-nak is) receptora Atópia, asztma

Ile50Val (I75V, ha a szignálpeptidet beleszámolják) az extracelluláris doménben helyezkedik el, valin esetén a receptor erősebben köti az IL-4-t. A Glu576Arg polimorfizmus a jelátviteli intermedierekhez való kötődést változtatja meg. Mindkét esetben a receptor felerősödött jelátvitelét tapasztalták. A vizsgálatok alapján úgy tűnik, hogy az 576-os arginin atópiára hajlamosító hatása domináns, míg az 50-es valin autoszomális recesszív öröklődést mutat. Az egyik vizsgálatban a Glu576Arg polimorfizmus nemcsak asztmára hajlamosított, de a polimorfizmust mutató asztmásokban a betegség tünetei súlyosabbak voltak, így ennek a génváltozatnak betegség-módosító hatása is feltételezhető.



  1. Milyen szerepe lehet az MCP-1 -2518-as pozíciójában található A/G polimorfizmusnak asztmában?

magasabb MCP-1 ex presszió a G alléllel

  1. Milyen módszerrel lehet ismeretlen „asztma géneket” beazonosítani?

pozícionális klónozással

Teljes genomszűrés után a jelölt régió szűkítése sűrűbben elhelyezkedő mikroszatellita markerekkel (szokásos QT-k: IgE, AHR)‏

A leszűkített jelölt régióban SNP-k keresése (pl. 5 beteg-5 egészséges megszekvenálásával)‏

LD-k keresése az SNP-k között: haplotípusok azonosítása

Haplotípusok asszociációs vizsgálata különböző populációkon asztmával (pl.: TDT)‏

A leszűkített, asszociáló területen gének keresése adatbankokban

Gének expressziójának vizsgálata egér tüdőben (pl. asztmás vs egészséges)‏

Kiválasztott gén(ek) funkcionális vizsgálata



  1. Mondjon egy példát a pozícionális klónozással megismert asztma génekre!

HLA-G gén

1-es típusú cukorbetegség


  1. Mi a cukorbetegség?

A cukorbetegség krónikus betegség, amely genetikai és környezeti tényezők együttes hatására jön létre, anyagcserezavarok és érrendszeri szövődmények képében.

Az anyagcserezavarra a vércukor rendellenesen magas szintje (hiperglikémia) jellemző, ami együtt jár a fehérje- és a zsíranyagcsere, valamint a só víz és a sav-bázis háztartás zavaraival.

A hiperglikémiát az inzulin hiánya, vagy a meglévő inzulin hatástalansága okozza.


  1. Hogyan oszthatjuk fel a cukorbetegségeket?

-Inzulin dependens diabetes mellitus (IDDM) = 1-es típusú diabetes mellitus (1DM) = Fiatalkori diabetes (juvenile onset diabetes (JOD))

-NIDDM (non-insulin dependent diabetes mellitus) = 2 -es típusú diabetes mellitus (2DM) = Időskori diabetes (maturity onset diabetes (MOD))



  1. Mekkora körülbelül az 1DM előfordulása kaukázusi populációban?

1DM oka a hasnyálmirigy b-sejtjeinek elpusztulása miatt az inzulintermelés leállása. Túléléshez exogén inzulin.

  1. Milyen szakaszai vannak az 1DM-nek?

európai/USA populációkban: 0,4%

  1. Milyen mechanizmus okozza az 1DM-et?




  1. Milyen immunsejttípusok játszhatnak szerepet az 1DM-ben?

Antitest

  1. Milyen autoantigének jelentősek 1DM-ben?

Autoantigének: ICA (islet cell antibodies) szigetsejt ellenes antitestek

-IgG típusúak

-GAD65, 10p11, (glutaminsav dekarboxiláz= 65 kDA); hasnyálmirigyben (is) expresszálódik, GABA (gamma amino vajsav (g-amino butyric acid)) kialakítását katalizálja, GABA-n keresztül, gátolja az inzulin és a glükagon szekréciót, 60-80%-a az újonnan diganosztizált 1DM-esekben megtalálható. Coxsackie 4B vírusfehérjére hasonlít (molekuláris mimikri)

-Inzulin, 11p15, IAA (insulin auto-antibodies), újonnan diagnosztizált 1DM-ben 30-50%-ban, idősebbekben kialakuló 1DM-ben ritkább

IA-2 (ICA 512) tyrosin phosphatase, 2q35, Asp911Ala miatt katalitikusan inaktív, endokrín szervekben expresszálódik, állatkísérletek alapján (KO) szerepe van az inzulin szekrécióban, újonnan diagnosztizált 1DM-ben 60-70%-ban



  1. Mi az a molekuláris mimikri?

Egy a szervezetben található fehérje molekuláris felépítésben hasonlít egy a szervezet számára idegen fehérjére.

  1. Melyek a fontosabb környezeti tényezők 1DM-ben?

-Vírusok a.) autoimmun folyamat indukálása útján: rubeola, Coxsackie B4

b.) közvetlen szigetsejt destrukció útján:

mumps-, Coxsackie B4-, CMV, rubeola

Pl.: 1DM-esek 22%-ban kimutatható a citomegalovírus genomja, míg a kontrollcsoportban csak 3%-ban

-Toxinok (direkt sejtpusztítás, vagy neoantigén létrehozása)

N-nitroso származékok (táplálék konzerválás)

magas nitrát tartalmú ivóvíz

rodenticidek (rágcsáló írtó szerek)



-Anyai tényezők: alacsony anyai életkor, magas születési súly

-Táplálkozási tényezők: tehéntej-fehérjék (csecsemőkorban egyes tehéntej eredetű peptidek felszívódhatnak, amelyek hasonlítanak egyes szigetsejt eredetű peptidekre: molekuláris mimikri), gyors súlyfejlődés



-Psychés stressz, D vitamin hiány

  1. Hol van az a kromoszóma régió amely az 1DM családi halmozódásában a legfontosabb?

6p21.3: MHC, HLA II, DRB1, DQB1 a fő IDDM1, de módosít: HLA DPB1, HLA B, HLA III

  1. Melyik az a két haplotípus amelyik a legjobban hajlamosít 1DM kialakulására?

DR3DQ2 haplotípus, DR4.DQ8 haplotípus

  1. Mondjon példát az 1DM kialakulásában szerepet játszó 6p21.3 pozícióban található génekre a HLA classII-ben található géneken kívül!

HLA-B8, TNFA2, C4AQ0, C4B1, DR3, DQ2; Antigén processing: TAP1, TAP2 (ATP-binding cassette transporter1 és 2); LMP2, LMP7 (large multifunctional protein): Peptideket transzportálják a citoszolból az ER-ben az MHC I-nek.;TNFa -308A, limfotoxin (TNFb), Hsp70.

  1. Mi jellemző az IDDM2-re?

-Inzulin gén és az insulin-like growth factor 2 (IGF2) gén közelében 11p15.5.

-OR = 3, ls=1.12

-VNTR 596 bp upstream (5’ oldalon): 14-15 bp ismétlődés


    • Class I 20-63db: hajlamosít homozigóta (2-5x): fehérekben 0,71 a gyakorisága

    • Class II 64-139, fehérekben nincs

    • Class III 140-210: domináns védelem, fehérekben: 0,29 a gyakorisága

-Ezek további alcsoportokra oszthatók a határoló haplotípusok alapján. Pl. Class IC+, IC-, ID-, ez utóbbi lehet védő is. És class IIIA és IIIB, amelyek sorrendben védő illetve nagyon védő.

-(VNTR= variable number of tandem repeat)



  1. Az IDDM5-ben található SUMO4 gén polimorfizmusa milyen mechanizmussal hajlamosít 1DM-re?

SUMO4 (small ubiquitin-like modifier 4).

Funkciója: NFkB (transzkripciós faktor) jelátviteli útvonal gátlása



  1. Milyen jelölt gén van az IDDM12 régióban?

CTLA4, CD28, ICOS: általános autoimmun gének

  1. Mondjon példát az 1DM-mel kapcsolatban bemutatott genomszűrésben kapott eredményekre?

-Legerősebb asszociáció a HLA régióval (IDDM1); LOD = 42,6, lókusz specifikus ls=3,6: 3,6-szeres az előfordulása a testvérben az 1DM-nek a populációban tapasztalt gyakoriságához képest a lókusz (HLA) miatt. Ez kisebb, mint az össz ls (=15), ami igazolja a multilókusz hipotézist.

-INS VNTR megerősítve TDT-vel: heterozigóta szülők a hajlamosító allélt többször adták át a betegnek, mint nem: 261 vs 164 (P=10-6). Nem érintett gyerekeknél nem volt ilyen különbség (84 vs 89). Kapcsoltsági analízissel nem volt különbség a hajlamosító allél nagy gyakorisága miatt.

-IDDM1 és IDDM2 között interakció van.

-IDDM1 és IDDM15 (6q) között kapcsoltság van (30cM távolságban vannak egymástól), IDDM15-re a harmadik legerősebbek a bizonyítékok.

-Interakció a 16S3113 marker és az IDDM1 között: a marker gyakrabban fordul elő HLA-DR3/4 genotípusú betegekben.

-Interakció a 16S3113 marker és az IDDM2 között: a marker gyakrabban fordul elő INS-/- genotípusú betegekben.

-EIF2AK3 (2p12) Wolcott-Rallison szindrómában mutált, amiben 1DM alakul ki születés után. A HLA DR3/4- es genotípusúakban kapcsoltságot találtak a lókusz és az 1DM között (LOD=2,6): a HLA DR3/4 genotípusuakban az EFF2AK3 szerepet játszhat az 1DM kialakulásában.

-IDDM7-IDDM13 kapcsolatát nem igazolták.



  1. Milyen betegségekre hajlamosít a PTPN22 variánsa?

Polimorfizmus a PTPN22 génben (R620W) erős asszociációt mutat számos autoimmun betegséggel (pl.:IDDM, RA, SLE stb)

  1. Az 1DM-mel kapcsolatban bemutatott QTL analízis során milyen állatokat használtak? Mi volt az állatok fenotípusa?

-NOD = non-obese diabetic

-NOD egér: alacsony az természetes ölő sejtszáma (NKTc), 1 DM mellett más autoimmun betegségekre is hajlamos



  1. Az 1DM-mel kapcsolatban bemutatott QTL analízis során mi volt a QT?

QT: NKT sejtszám, 8cM felbontás, 181 marker, 19 kromoszóma

2-es típusú cukorbetegség


  1. Milyen szakaszai vannak a 2DM kialakulásának?

Perifériás szövetek inzulinrezisztenciája (máj, váz- és szívizmok, zsírszövet), hiperinzulinémia

Csökkent perifériás glükóz felvétel

Hiperglikémia

Szigetsejtek csökkent glükóz-érzékenysége (glükotoxicitás)

Csökkent inzulin szintézis és elválasztás

Hipoinzulinémia

A 3 szakasz:

1. Örökletes hajlam + környezeti tényezők

2. Inzulinrezisztencia

3. Hipoinzulinémia, hiperglikémia



  1. Nagyságrendileg hány 2DM-es beteg van a világon?

Előfordulása jelenleg: 5-50%; 240 millió (2007), évente 7 millióval nő

  1. Milyen nem közvetlenül génekhez kapcsolható tényezők hajlamosítanak 2DM-re?

Kialakulása genetikai (nem befolyásolható) és környezeti tényezők változó (befolyásolható) hatásától függ

Túlsúly, táplálkozás, mozgáshiány, életkor, magzati és kora csecsemőkori táplálkozás (alacsony testsúllyal születettekben sokkal gyakoribb a 2 DM: 17-20% vs 2-6%.

  1. Mi utal a takarékos gének szerepére 2DM-ben?

Olyan etnikumoknál fordul elő nagyon gyakran, akik korábban táplálékban szűkös környezetben éltek (Pima indiánok, ausztrál bennszülöttek, Nauru szigete), de a fehér ember megjelenésével ez megváltozott (coca-kolonizáció).

UK-ban a világháborúk alatt, pl. a jegyrendszer bevezetésekor szignifikánsan csökkent a 2DM betegek száma.



  1. Mi az az inzulin rezisztencia?

a célszövetek csökkent válasza a normális inzulinszintre

  1. Mi az inzulin rezisztencia kialakulásának legfontosabb oka?

receptor kötődéstől a jelátvitelen keresztül a, génaktivációkig (transzkripciós faktorok) mindenhol lehet

Legfontosabb oka: obezitás. Kb. 80%-a a 2DM-eseknek túlsúlyos,vagy obez. Mind a zsigeri, mind a bőralatti zsírszövetek egymástól függetlenül okozhatják az inzulin rezisztenciát.



  1. Hogyan növelhetik a zsírsejtek az inzulin rezisztenciát?

A zsírszövetekből felszabaduló szabad zsírsavak gátolják a glükóz feldolgozását: gátolják a máj glükózfelvételét és növelik a hepatikus glükóz kibocsátást. Versenyeznek a glükózzal az oxigénért

Triacilgliceridek formájában tárolják az energiát

Az energiafelhasználást szabályozzák: inzulin (pankreász), katekolaminok (szimpatikus idegrendszer), glükokortikoidok (mellékvese)

Önmaga is termel hormont: leptin, és más fehérjéket: adiponectin, TNFa, IL-6, resistin melyek befolyásolják az inzulinrezisztencia kialakulását.

Alacsony adiponectin, magas TNFa, magas IL-6, magas resistin mind okozhat inzulin rezisztenciát.

Pl.: TNFa gátolja az inzulin receptor foszforizációját.



  1. Hol expresszálódik a resistin gén?

csak a zsírszövetben expresszálódik

  1. Milyen szerepe lehet a resistinnek az inzulin rezisztenciában?

TZD antidiabetikus szer mely hatását a peroxisome proliferator activated receptor- g (PPARg) aktiválásán keresztül fejti ki. Hatására csökken a resistin szint.

A resistint a zsírsejtek termelik

Resistin szintje magasabb ob/ob (leptin hiányos) és db/db (leptinreceptor hiányos) extrém kövér egerekben

Semlegesítése: csökken a hiperglikémia (inzulin rezisztens egerekben), és növekszik az inzulin érzékenység

Adagolása: romló inzulin érzékenység


  1. A 2DM-nek kb. hány százaléka monogénes eredetű?

5%-a monogénes

  1. Miért nehéz a 2DM genetikai analízise?

A fenotípus orientált kutatás nem ismeri még eléggé a 2DM patogenezisét.

A multifaktoriális patogenezis miatt nem várható Mendel típusú öröklésmenet

Az alacsonyabb életkilátások és a késői manifesztáció miatt az érintettek szülei már nem élnek, nincsenek kiterjedt családfák tiszta öröklődési menettel

Kevés a lehetőség a hagyományos „lod score” alapú családfa analízisre



  1. Melyik a MODY2 génje és mi a szerepe?

2. kromoszóma 7, glükokináz (MODY-2)

  1. Melyik gén mutációja a leggyakoribb oka a MODY-nak?

MODY3: 12q: HNF1a, (mint a HNF4a) leggyakoribb ok (esetek 65%-a) Franciaország kivételével

  1. Mit befolyásolnak az eddig talált MODY gének?

Az eddig talált MODY gének az inzulin szekréciót befolyásolták

  1. A MODY géneken kívül milyen mutáció okozhat közvetlenül 2DM-et?

Mutációk előfordulnak az inzulin és az inzulin receptor génekben is. Ez utóbbi markáns inzulin rezisztenciával jár.

Populációs jelentőségük a 2 DM-ben kicsi.



  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott genomszűrésben milyen szempontok alapján válogatták a betegeket?

Barroso I et al. Candidate gene association study in type 2 diabetes indicates a role for genes involved in b-cell function as well as insulin action PLOS Biology 2003; 1:41-55; http://biology.plosjournals.org

Jelölt gének melyek befolyásolják :

Hasnyálmirigy funkcióját

Inzulin hatását, és a glükóz metabolizmusát

Energiafelvételt és leadást, az evést, lipidek metabolizmusát

Egyéb; pl. nitrogén oxid szintáz3 (NOS3)

-fSSCP: fluorescent single stranded conformation polymorphism módszerrel keresték az SNP-ket

-71 gént szűrtek végig 47 kevert etnikumú mintán: 99% a valószínűsége, hogy minden olyan polimorfizmust megtalálnak, melynek 5%, vagy annál nagyobb a gyakorisága

-954 SNP, fr.: 0.003-0.50.

-Becsült jelentőségük alapján 152 SNP-t kiválasztottak


  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott teljes genom asszociációs vizsgálatban nagyságrendileg hány SNP-t vizsgáltak?

-954 SNP, fr.: 0.003-0.50.

-Becsült jelentőségük alapján 152 SNP-t kiválasztottak



  1. Mondjon példát arra, hogy a 2DM-ben a teljes genom asszociációs vizsgálatban milyen génnel találtak asszociációt!

Az ABCC8 és a KCNJ11 genomszerveződése és a vizsgált polimorfizmusok Caplain-10

  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott jelölt gén asszociációs vizsgálatban milyen típusú géneket vizsgáltak?

Barroso I et al. Candidate gene association study in type 2 diabetes indicates a role for genes involved in b-cell function as well as insulin action PLOS Biology 2003; 1:41-55; http://biology.plosjournals.org

Jelölt gének melyek befolyásolják :

Hasnyálmirigy funkcióját

Inzulin hatását, és a glükóz metabolizmusát

Energiafelvételt és leadást, az evést, lipidek metabolizmusát

Egyéb; pl. nitrogén oxid szintáz3 (NOS3)

-fSSCP: fluorescent single stranded conformation polymorphism módszerrel keresték az SNP-ket

-71 gént szűrtek végig 47 kevert etnikumú mintán: 99% a valószínűsége, hogy minden olyan polimorfizmust megtalálnak, melynek 5%, vagy annál nagyobb a gyakorisága

-954 SNP, fr.: 0.003-0.50.

-Becsült jelentőségük alapján 152 SNP-t kiválasztottak


  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott jelölt gén asszociációs vizsgálatban milyen kérdésekre kerestek választ?

-Melyik SNP asszociál 2DM-mel (fokozott, vagy csökkent kockázat)? Case-control vizsgálat. (517-517 résztvevő)

-Az egymás mellett levő SNP-kből alkotott haplotípusok asszociálnak-e 2DM-mel?

-Asszociálnak-e a 2DM-mel összefüggést mutató SNP-k és/vagy haplotípusok köztes fenotípusokkal. QT vizsgálat.


  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott jelölt gén asszociációs vizsgálatban milyen QT-ket vizsgáltak?

QT-k: BMI (testtömeg index), éhgyomri glükóz szint, cukorterhelés utáni 2 órás glükóz szint, éhgyomri inzulinszint, 30 perces inzulin szint növekedés (1100 2DM-es beteg)

  1. Mondjon példát a 2DM-mel kapcsolatban bemutatott jelölt gén asszociációs vizsgálatban a -sejt funkcióját befolyásoló génekre, amelyekben található polimorfizmus befolyásolja a betegségre való hajlamot!

ATP érzékeny K+ csatorna

-ABCC8: sulphonylurea receptor1 (SUR1): ABC transporter containing transmembrán protein, ATP kötő kazetta; SUR1 antidiabetikus szert köt(szulfonilurea).

-ABCC8 SNP84: 2DM: OR: 3.43 (p = 0.016), QT: BMI, magas éhgyomri glükóz, SNP87: 2DM: 3.9, QT csökkent inzulin szekréció.

-KCNJ11: kálium-csatorna KIR 6.2: Kr.11p15.1, 4,5 kb-ra egymástól, b-sejteken a csatornafehérjét (KIR6.2) és annak szabályzóját kódolják.

-KCNJ11 E23K (SNP77): OR:1.49, funkcionális vizsgálatok alapján a sejtekben emelkedett az inzulinszekréciós stimulációs küszöböt okoz. Összességében a 3. legfontosabb T2D gén.

-Az ABCC8-ban talált 5 szignifikáns SNP közül kettő mutatott LD-t az E23K-val, 3 nem. -Ezek hatása független kockázatot mutatott



-SLCA2: 3q26.1-26.3, glükóz transzporter (GLUT2): hasnyálmirigy b-sejtjeiben és a májban expresszálódik. A glükóz bejutását szabályozza a hasnyálmirigybe. A májban a glükózfelvételben és leadásban játszik szerepet.

-3 SNP-re kaptak szignifikáns eredményt, OR= 1,4-1,5 növelte a 2DM-re való hajlamot, domináns modell, QT: alacsony éhgyomri inzulin



-HNF4A: 20q12-13.1 (MODY1 gén): transzkripciós faktor, a b sejtekben szabályozza az inzulinszekréciót és a glükóz transzportot szabályozó géneket (pl. a GLUT2-t szabályozza)

-Csak 1 haplotípus (B) mutatott csökkent betegség kockázatot (OR = 0.83); QT: emelkedett inzulinszekréció.

-Mivel a missense és a nonsense mutációra heterozigótáknak kórosan alacsony az inzulinszintjük=inzulinopénia, (az ún. „haploinsufficiency” miatt), valószínűleg a b-sejteknek szükségük van mindkét aktív HNF4A génre, hogy működésükhöz megfelelő mennyiségű HNF4a legyen.

-Valószínüleg a haplotípus B megnövekedett fehérje expressziós szintet okoz, így véd a 2DM ellen



-INS:11p15.5, preproinzulin gén

-3’ UTR található SNP asszociált 2DM-kockázatával (OR= 2,02) recesszív modell alapján; QT vizsgálatban nem találtak asszociációt. Hatásmechanizmust nem lehet tudni. Lehet, hogy LD-ben van egy funkcionális mutációval.

-UTR= untranslated region: nem átíródó génszakasz


  1. Mi az a haploinsufficiency?

Ha a fehérje normális működéséhez mindkét génjének teljes működése szükséges, akkor azt az állapotot amikor az egyik gén nem működik megfelelően (és ez általában betegséghez vezet) haploinsufficiency-nek hívják (kb. haploelégtelenség)

  1. Mondjon példát a 2DM-mel kapcsolatban bemutatott jelölt gén asszociációs vizsgálatban az inzulin hatását befolyásoló génekre, amelyekben levő polimorfizmus befolyásolja a betegségre való hajlamot!

  • INSR: 19p13.2, inzulin receptor,

  • Intron variáció asszociált 2DM kockázatával (SNP131, OR=1.48), domináns modell, QT: magasabb vér glükózszint,

  • Haplotípus elemzés: haplotípus C emelkedett betegség kockázattal asszociált

  1. Mi lehet a PPARG szerepe 2DM-ben?

PPARGC1:PPAR-GAMMA COACTIVATOR 1-ALPHA, 4p15.1: energia metabolizmust regulálja (adaptív termogenezis, mitokondriális biogenezis, zsírsavak b-oxidációja , hepatikus glükoneogenezis, glükóz felvétel),

  1. A PPARG Pro12Ala mutációnak milyen szerepe van a 2DM-re való hajlamban?

Pro12Ala: csökkentett kockázat: OR=0.78: több populáción megerősítve

  1. Mi az eNOS és milyen szerepe lehet 2DM-ben?

eNOS: endothelial nitrogen oxid synthase, 7q36, NO modulálja többek között a hepatikus glükóz metabolizmust és inzulinszekréciót.

  1. Melyik az első gén, amelyet összefüggésbe hoztak multifaktoriális 2DM-mel, és mi lehet a szerepe?

  • Calpain-10, Az első gén volt amit összefüggésbe hoztak 2DM-mel (mexikói-amerikaiakban), ezért elnevezték NIDDM1-nek, 2q37.3, proteáz (fehérjebontó enzim)

  • Gátlása megnövekedett glükóz indukálta inzulinszekréciót okoz a b-sejtekben és csökkent inzulin-indukált glükózfelvételt az izmokba és a zsírsejtekbe,

  • 2DM-mel összefüggésbe hozott polimorfizmusai mindegyik intronvariáció, ezek egyik haplotípus variációja járt fokozott 2DM hajlammal

  1. Milyen génben előforduló mutáció okozhat 2DM-et a spontán hipertenzív patkány modellben?

Patkányokban: CD36 gén, FAT (fatty acid translocase): befolyásolja az inzulinrezisztenciát. Emberben: 7q11.2.

SHR (spontaneously hypertensive rat): inzulin rezisztencia, emelkedett TG, csökkent HDL-C, magasvérnyomás: mind a 4-es kromoszómán mutat LOD score csúcsot: itt van a CD36. Ez az állat defektív CD36-ra. Hasonló a fenotípus CD36 hiányos emberben.

CD36: A hosszúláncú zsírsavak transzportjáért felel, oxLDL-nek is receptora (scavanger). PPARg indukálja.

Hiányában csökkent lipid clearance: emelkedett szérum lipidek®szabad zsírsavak ®inzulin rezisztencia

2DM oka lehet, hogy lipid anyagcserezavar (nem glükóz)


  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott QTL analízisben milyen QT-ket használtak?

Vizsgált QT-k: glükóz tolerancia, éhgyomri glükózszint, inzulinszint, koleszterinszint, trigliceridszint, testtömeg.

  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott QTL analízisben miket vizsgáltak?

KK/Ta: poligén modell, Japánban fejlesztették ki: spontán 2DM

Vizsgált QT-k: glükóz tolerancia, éhgyomri glükózszint, inzulinszint, koleszterinszint, trigliceridszint, testtömeg.

  1. A 2DM-mel kapcsolatban bemutatott QTL analízisben hogyan vizsgálták a gén-gén kölcsönhatást?

Az emelkedett éhgyomri glükózszinttel asszociált két kromoszóma lókuszt és a (12-es és 15-ös kromoszómán) magas trigliceriddel asszociált két lókuszt (4-es és 8-as) vizsgálták, hogy egymással kölcsönhatásban okozzák-e a kapott fenotípust.

A vizsgálatban azt nézték, hogy a betegségre hajlamos KK/Ta törzsből és a rezisztens BALB/c törzsből származó mikroszatellita variációk együtt, vagy egymástól függetlenül okozzák-e a QT-t.


Obezitás


  1. Mi az obezitás?

Olyan mértékű testzsír felszaporodás ami már károsan befolyásolja az egészséget.

  1. Milyen típusú obezitás a legveszélyesebb?

Különösen a hasi (intra-abdominális) testzsír a veszélyes.

  1. Mit használnak legelterjedtebben a kövérség mérésére?

Jelenleg a leggyakrabban a testtömeg indexet (BMI) használják

  1. Melyek a testtömeg hosszútávú szabályozásának legfontosabb hormonjai?

Hosszútávú szabályozás: leptin (zsírsejtek termelik) és inzulin. Mindkettő szintje emelkedik ha nő a testtömeg (zsírtömeg).

A zsírsejtek által kibocsátott molekulák egy része inzulin rezisztenciát okoz (TNFa, IL-6, resistin), így emelve a normoglikémia fenntartásához szükséges inzulinszintet.

A zsírsejtek méretének és mennyiségének arányában a keringésbe egyre több leptin kerül.

Mind a két hormon a központi idegrendszerben hatva csökkenti az étvágyat és növeli az energia felhasználást.



  1. Melyek a testtömeg rövidtávú szabályozásának legfontosabb hormonjai?

  • Ghrelin: gyomor termeli ha üres, növeli az étvágyat

  • Cholecystokinin: evés közben termelődik a bélrendszerben, a teltségérzést okoz.

  • PYY(3-36). Neuropeptid Y családba tartozik, a vékony- és a vastagbél endokrín sejtjei termelik, ha étel van a belekben. Étvágyat csökkent. (Adagolása 12 órára lecsökkenti az evést állatokban és az emberben is: kísérletek folynak, mint fogyasztószer)

  • Mindegyik hormon a hipotalamuszban hat a nucleus arcuatusban (kb.ív alakú mag).

  1. Hol hatnak a testtömegszabályozás perifériás hormonjai az agyban?

Mindegyik hormon a hipotalamuszban hat a nucleus arcuatusban(ív alakú mag)

  1. Mondjon példát genetikailag módosított obez egérmodellre!

Agouti egerek anyjai a terhesség alatt különböző mennyiségű metil donort (B12 vitamin, fólsav stb.) kaptak enni. Minél többet ettek, annál soványabb és barnább lett az utódjuk.

  1. Miért kövér az agouti egér?

Domináns öröklődésű: agouti yellow (Ay): itt funkciónyerés van (gain of function), hiszen a mutáns állatban minden sejtben, folyamatosan expresszálódik a fehérje, ami normálisan csak újszülöttkorban

a szőrtüszőkben



  1. Mi lehet a leptin rezisztencia oka?

Leptin rezisztencia okai lehetnek a leptin csökkent transzportja az agy-vér gáton keresztül és a csökkent receptor érzékenység

  1. Milyen obez egérmodell van, amelyben sérült az inzulin jelátvitel?

NZO

  1. Milyen bizonyítékok vannak a kövérség öröklődésére?

Ikerkutatások: 40-70%-ban öröklődő a testzsír eloszlás és a teljes testzsír mennyisége

Egypetéjű ikrek konkordanciája: 0,7-0,9

Kétpetéjű ikrek: 0,35-0,45

Külön nevelt egypetéjű ikrek: 0,4-0,7

5000 dán egyén: BMI csak a biológiai szülővel korrelál

λls = 0,7/0,2= 3,5

Testmagasság: 75-90%


  1. Mondjon példát a genetikai faktorok által befolyásolt tényezőkre, amelyek szerepet játszanak a testsúlyban!

Anyagcsere

-Resting metabolic rate (RMR): anyagcsere a nyugalmi állapotban

Termogenezis, felszívódás

Testzsíreloszlás

Éhség kontroll

Étel preferencia

Fizikai aktivitás


  1. Milyen formákban használódhat fel a szervezetben az energia?

Az étel formájában bekerülő energia hő vagy munka formájában távozik, vagy beépül. A teljes energiafelhasználást 3 részre lehet osztani:

1. a szervezet normális működéséhez szükséges energia

2. Fizikai munka

3 Adaptív termogenezis az hő termelése (környezeti hőmérsékletre való alkalmazkodás, de az ételbeviteltől is függ)



  1. A szimpatikus idegrendszernek milyen szerepe lehet a testsúlyszabályozásban?

Szimpatikus idegrendszer szerepe az adaptív termogenezisben. A barna zsírszöveteket és a vázizmokat idegzi be. Fő szereplő: adrenalin, noradrenalin. Hiányuk egérben: nem tudnak alkalmazkodni a hideghez

  1. Milyen szerepe van az UCP-knek a termogenezisben?

-A barna zsírsejt egyik legfontosabb molekulája: UCP-1 (uncoupling protein-1). UCP-1 KO egér nem tud alkalmazkodni a hideghez

-UCP-1 szerepe a mitokondriumban: a kipumpált protonokat hőtermelés mellett ereszti vissza



  1. Milyen tünetei lehetnek a kongenitális leptinhiánynak?

Monogénes obezitások:

  • Leptin: 7q31.3; Kongenitális leptinhiány: ritka, 5 család a világon, ob/ob egér

  • korai obezitás, nagy ételbevitel, hiperinzulinémia, T sejt szám és funkció zavara, hypogonadotropic hypogonadismus

  • DG133: rövid leptin, nem hajtogatódik jól, nem expresszálódik

  • Missense mutáció: Arg105Trp (BMI:55,8)

  • heterozigóták is kövérebbek (23%-kal magasabb testzsír)

  1. Milyen genetikai defektusa van a db/db egérnek, és mi a jellemző fenotípusa?

Leptin receptor hiány

  • 1p31

  • db/db egér

  • Diverzebb fenotípus, pl: csökkent GH termelés, központi hypothyroidismus, agresszió az élelemért stb.

  • IVS16, G-A, +1, splice junction mutáció, három egymással rokon családban

  1. Mi az a domináns negatív mutáció?

Domináns negatív mutáció: hatása heterozigóta formában is >50% funkcióromlás. Pl.: torz fehérje keletkezik, amelyik tönkreteszi a normális homológ fehérje működését/hatását.

  1. A leptinhiányon kívül milyen más mutációt ismer, amely obezitást okoz?

Pro-opiomelanocortin (POMC) domináns negatív mutáció

Prohormone Convertase (PC)1 mutáció

Melanocortin 4 receptor (MC4R) mutáció


  1. Melyik génnek a mutációja az oka leggyakrabban a morbid obezitásnak?

Melanocortin 4 receptor (MC4R)

18q22


  1. A bemutatott obezitás QTL vizsgálatban milyen állatokat használtak és hogyan?

Obezitás QTL vizsgálat egerekben:

  • Előnyök: környezeti és genetikai háttért kontrollálni lehet, beltenyésztett törzsek széles választéka, meghatározott fenotípussal, obezitás különböző genetikai háttérrel. Különböző tényezőket külön lehet tanulmányozni. Pl. energia leadás, hiperfágia, gén+környezet kölcsönhatás.

  • Egyes törzsek közötti kis kövérségi különbségeket magas zsírtartalmú ételekkel fel lehet erősíteni.

  1. Az NZO egérben milyen mutációt találtak a 6-os kromoszómán?

A 6-os kromoszómán az Obq13 közelében: Neuropeptide Y. Szabályozza az élelmiszer bevitelt és befolyásolja az energia metabolizmust.

NPY 3’ UTR szekvenciája 7 állatban. Az NZO egérben egy nukleotid (T) kiesett. Ez egy konzervált régió, szerepet játszik az mRNS turnover-ben és a transzlációban. Aminosavcserét nem találtak



  1. A bemutatott obezitás genomszűrésben milyen QT-t használtak?

QT-k: BMI, zsírtömeg, soványtömeg (zsír és csontnélküli), PFM (zsírtömeg/testtömeg). Ezeket speciális szkennerekkel mérték (DXA Hologic 2000 vagy 4500 scanner).

  1. Milyen tünetekkel jár a PPAR mutációja?

3p25, peroxisome proliferator-activated receptor-gamma, transzkriciós faktor magreceptor, zsírsejtek differenciálódásában van szerepe

Funkcióvesztést okozó mutációja: obezitás, 2DM, inzulinrezisztencia, magasvérnyomás (is)



  1. Melyik a fő receptor a lipolízisben?

Béta 2 adrenerg receptor (ADRB2

  1. Melyik kromoszómán van a TNFα génje?

  • 6p21.3 (MHC)

  1. Melyik gén obezitásra hajlamosító polimorfizmusa fordul elő csak afrikai származásúakban?

Az exon 6-os polimorfizmust hordozókban 50%-kal csökkent az alap zsírlebontás, afrikai- amerikaiakban gyakoribb az obezekben(30%) mint a soványakban (15%), fehérekben nincs (Afrikában takarékos gén?)

  1. Milyen módszerrel találták meg az INSIG2-t, mint az obezitás egyik jelölt génjét?

INSIG2: insulin induced gene 2

Haplotípus vizsgálat



  1. Milyen szerepe lehet a GAD2-nek a testtömegszabályozásban?

  • GAD2 az agyban is termelődik (+pankreász b-sejt), GABA (gamma amino vajsav (g-amino butyric acid)) kialakítását katalizálja, ami az NPY-nal együtt fordul elő, és a leptin útvonalban működnek együtt. Az NPY-nal együtt stimulálják az evést.

  • GAD2 antisense-t a hipotalamuszba juttatva csökkenti az evést

  1. Hogyan kerestek SNP-ket a GAD2 génben a bemutatott példában?

  • SNP keresése: 16 exont és az 5’ és 3’ UTR-t szekvenálták 24 obezben és 24 kontrollban.

  • 15 SNP-t választottak frekvencia és elhelyezkedés alapján. 48 morbid obezben és 48 kontrollban genotipizálták őket, majd 6-ot választottak amelyek nem voltak LD-ben és frekvenciájuk >10%.

  1. Hogyan ellenőrizték a bemutatott példában, hogy valóban a GAD2 gén lehet az obezitásban szerepet játszó gén?

Asszociációs vizsgálat: a 6 SNP genotipizálása 349 morbid obez és 383 kontrollban.

Az eredmények megerősítése további 226 morbid obezben és 270 kontrollban

Pedigree disequilibrium test (hasonló a TDT-hez)

Family-Based Association test (FBAT)


Több genomszűrés talált kapcsoltságot a 10p11-12-n a D10S197 marker és a obezitás között: francia, német, amerikai fehér, fekete

A használt mikroszatellita marker a GAD2 (GAD65) gén (glutaminsav dekarboxiláz 65) 7-es intronjában van

Módszer 188 család, amelynek egyik tagja BMI > 40, és még egy tag BMI > 27 (összesen 620 egyén).

16 marker 1 cM-enként a D10S19 marker körül.

Eredmény: A maximális LOD score (3,4) (kapcsoltság az obezitással) 2 csúccsal tényleg a GAD2 génben.

Cél: olyan polimorfizmus keresése amelynek funkció változtató hatása van és hajlamosít az elhízásra



  1. Hol találták a legerősebb összefüggést az obezitással a GAD2 génben?

10p11-p12

  1. Hogyan vizsgálták meg, hogy a GAD2 gén szabályozó régiójában található polimorfizmus milyen funkcionális változásokat okoz?

Több genomszűrés talált kapcsoltságot a 10p11-12-n a D10S197 marker és a obezitás között: francia, német, amerikai fehér, fekete

A használt mikroszatellita marker a GAD2 (GAD65) gén (glutaminsav dekarboxiláz 65) 7-es intronjában van

Módszer 188 család, amelynek egyik tagja BMI > 40, és még egy tag BMI > 27 (összesen 620 egyén).

16 marker 1 cM-enként a D10S19 marker körül.

Eredmény: A maximális LOD score (3,4) (kapcsoltság az obezitással) 2 csúccsal tényleg a GAD2 génben.

Cél: olyan polimorfizmus keresése amelynek funkció változtató hatása van és hajlamosít az elhízásra



  1. Mondjon példát az obezitással kapcsolatban bemutatott teljes genom asszociációs vizsgálat eredményeire!

Asszociációs vizsgálat: a 6 SNP genotipizálása 349 morbid obez és 383 kontrollban.

Az eredmények megerősítése további 226 morbid obezben és 270 kontrollban

Pedigree disequilibrium test (hasonló a TDT-hez)

Family-Based Association test (FBAT)



  1. Az SLC6A14 gén milyen mechanizmussal okozhat obezitást?

Az SLC6A14 gén egy olyan ioncsatornát kódol, amely a triptofán szállítását is végzi az agyban. A triptofánból szintetizálódik a szerotonin.

A szerotonin befolyásolja a telítettség érzést.

AZ SLC6A14 gén hibája kevesebb szerotonint és csökkent teltségérzetet okozhat, ami növelheti az obezitás kockázatát


  1. Magyarázza a takarékos gén elméletével az obezitás napjainkban tapasztalható nagy gyakoriságát!

  • Bizonyos etnikumok alkalmazkodtak az állandó, és a periódikus éhezéshez.

  • A mai táplálék-bőségben állandó kalóriabevitel és raktározás folyik. A soványak a kivételek, akik valamilyen mutációval elvesztették a meglevő raktározási képességeiket, vagy valahogyan kicsúsztak a szelekciós kontroll alól.

  • Példa: 300 nőből 29% nem hízott fiatal kora óta.: aromatase P450 (CYP19) génben a 4.intronban van egy tetranukleotid ismétlődés (TTTA). A magasabb repeatszám: magas 17 b-estradiol szinttel jár és alacsony androgén szinttel: soványabbak, egészségesebbek, mint a rövid TTTA ismétlődésűek, akiknek magasabb az androgénszintjük és kövérségre hajlamosabbak

  1. Az obezitással kapcsolatban bemutatott komplex vizsgálatban miket vizsgáltak?

Izlandi populáció

23.720 gén expressziója vérben és zsírszövetben

Gének expressziója és az obezitás kapcsolata: a zsírszövetben 17.000, a vérben 2.170 gén expressziója asszociált a BMI-vel.

1.732 mikroszatellita marker szűrés: kb. 2.000 génnél találtak cis (közelében) ható markert, azaz összefüggés volt az expresszió és a marker között. A trans hatás (azaz távoli) 50x kevesebb volt.

317.503 SNP szűrés: kb. 3.000 génnél találtak cis ható SNP-t.

Korábban transzkripciós hálózatot számoltak az együtt változó génekből: macrophage-enriched metabolic network (MEMN) génjeinek 98%-ának az expressziója asszociált obezitással.

A MEMN SNP-i szerepet játszanak az obezitásban: a gyulladási- és az immunválasz génjei fontos szerepet játszanak az obezitásban.


  1. Mi a különbség az MC3R KO és az MC4R KO egér fenotípusa között?

  • Mc3R KO egér:

  • 26 hetes koráig nem tűnik kövérnek, bár zsírtömege nagyobb, mint a vad típusnak (az izomszövet rovására). Egyetlen különbség: kevesebbet mozog. Nem eszik többet, de az ételből több zsírt raktároz el a sovány izmok rovására. Emberben jó jelölt a „takarékos génre”.

  • Mc4R KO egér többet eszik. És ezért kövér: kövérsége arányos a megevett étel mennyiségével.

  • Dupla KO: nagyon kövér: sokat eszik és jól raktározza.

  1. Milyen fenotípust befolyásol az MC4R C2745T polimorfizmusa?

A “lustaság” (csökkent hajlandóság mozgásra) genetikailag meghatározott

A fizikai inaktivitás fontos kockázati tényező több betegségre: pl. elhízás, magas vérnyomás, 2DM stb.



Szignifikáns összefüggést találtak a fizikai inaktivitás és az MC4R egyik polimorfizmusa között (MC4R-C2745T; TT homozigóta).



Yüklə 327,75 Kb.

Dostları ilə paylaş:
1   2   3   4   5




Verilənlər bazası müəlliflik hüququ ilə müdafiə olunur ©genderi.org 2024
rəhbərliyinə müraciət

    Ana səhifə