Genomni kartalashtirish reja: Genetik haritalash tarixi

Noma’lum genom ketma-ketliklarini aniqlashda, genomi aniqlangan organism de novo sharoitida genomni rekonstruksiya qilish ishlari olib borilgan, hozirda esa genom ketma-ketliklarining tahrirlash ishlari bo‘yicha ko‘plab xalqaro loyihalar faoliyat olib bormoqdalar. Bularga genomning ketma-ketliklari to‘plamlari misol bo‘la oladi, bunday holatlarda ketmaketliklarni o‘qishga ularning ma‘nosini aniqlash uchun ma‘lumotlar bazasidagi holati o‘rganiladi. Bu jarayon haritalash deyiladi. Haritalash ishlarini olib borishda, turlicha yondoshuvlar ishlatiladi, masalan, genomni haritalash uchun katta bo‘shliqlar yo‘q bo‘lishi kerak, RNK-sekvenirlash uslubi qo‘llanilganda, ketma-ketliklar o‘rtasida ajralishlar mavjudligi tufayli keng qo‘llaniladi. Umuman, haritalash ishlarini o‘tkazishda sekvenirlash uslubini qo‘llash davom etmoqda va oxirgi avlod sekvenirlash uslublari uchun o‘zgargani yo‘q, lekin oldingi avlod sekvenirlash uslublari uchun ishlab chiqilgan dasturlar ko‘p miqdordagi ma‘lumotlar bilan ishlash uchun mo‘ljallangan emas, shuning uchun, qisqa uzunliklarga ega bo‘lgan ketma-ketliklarni o‘qiydigan uslublar keng qo‘llaniladi.

• Noma’lum genom ketma-ketliklarini aniqlashda, genomi aniqlangan organism de novo sharoitida genomni rekonstruksiya qilish ishlari olib borilgan, hozirda esa genom ketma-ketliklarining tahrirlash ishlari bo‘yicha ko‘plab xalqaro loyihalar faoliyat olib bormoqdalar. Bularga genomning ketma-ketliklari to‘plamlari misol bo‘la oladi, bunday holatlarda ketmaketliklarni o‘qishga ularning ma‘nosini aniqlash uchun ma‘lumotlar bazasidagi holati o‘rganiladi. Bu jarayon haritalash deyiladi. Haritalash ishlarini olib borishda, turlicha yondoshuvlar ishlatiladi, masalan, genomni haritalash uchun katta bo‘shliqlar yo‘q bo‘lishi kerak, RNK-sekvenirlash uslubi qo‘llanilganda, ketma-ketliklar o‘rtasida ajralishlar mavjudligi tufayli keng qo‘llaniladi. Umuman, haritalash ishlarini o‘tkazishda sekvenirlash uslubini qo‘llash davom etmoqda va oxirgi avlod sekvenirlash uslublari uchun o‘zgargani yo‘q, lekin oldingi avlod sekvenirlash uslublari uchun ishlab chiqilgan dasturlar ko‘p miqdordagi ma‘lumotlar bilan ishlash uchun mo‘ljallangan emas, shuning uchun, qisqa uzunliklarga ega bo‘lgan ketma-ketliklarni o‘qiydigan uslublar keng qo‘llaniladi.
•