II INTERNATIONAL SCIENTIFIC CONFERENCE OF YOUNG RESEARCHERS
Baku Engineering University
52
27-28 April 2018, Baku, Azerbaijan
eeff
BB
1
R
1
R
2
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
180
179
180
180
-100
-158
-90
-134
-107
60
55
56
-59
180
-
90
180
91
180
-
179
174
179
179
130
165
-52
-56
-59
BL
3
R
3
R
2
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
182
179
178
184
-98
-120
-88
-144
-110
60
-58
56
-59
180
-
85
180
92
180
-
179
176
179
179
123
-58
-55
-61
-58
efff
BR
1
R
1
R
2
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
180
179
180
178
-100
-158
-90
-134
-107
60
55
56
-59
180
-
90
180
91
180
-
179
174
179
179
130
165
-52
-56
-59
LR
1
R
2
R
2
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
179
180
179
178
179
-101
-127
-89
-110
-109
59
-58
58
180
180
-
86
180
87
179
-
179
176
179
179
117
-61
-53
146
-60
LR
1
R
3
R
2
B
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
178
178
179
184
178
53
-134
-93
-103
-131
-57
62
-56
-55
59
-
86
181
95
178
-
179
175
179
181
58
165
-58
-57
-133
ffff
RR
1
R
3
R
1
B
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
180
182
187
183
-87
-149
-97
-102
-125
-181
60
-54
-56
60
-
89
180
96
179
-
179
176
179
180
-54
169
-62
-58
127
RR
1
R
3
R
1
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
180
182
191
189
-87
-149
-107
-99
-109
-181
60
-55
-58
179
-
86
177
98
180
-
179
176
179
179
-54
161
-63
-49
169
ffef
RR
3
B
3
R
2
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
181
182
188
179
183
-90
-145
-85
-144
-114
-178
-59
55
-59
180
-
94
180
94
180
-
179
177
179
180
-58
-62
-56
-66
-61
RR
3
B
1
R
3
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
180
180
178
179
-84
-107
238
-94
-110
-180
183
-57
-61
180
-
85
58
88
180
-
179
174
179
180
-53
155
124
-33
-60
feee
BL
3
B
2
B
3
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
182
175
186
179
-102
-142
210
-141
-110
60
-56
181
-54
180
-
90
180
86
180
-
179
175
179
180
132
156
147
149
-60
RB
1
B
1
B
1
R
Ala
Tyr
Thr
Tyr
Val
180
179
176
182
179
-87
-154
254
-140
-110
-180
60
59
56
180
-
90
180
91
180
-
179
174
179
180
-53
164
140
159
-60
Apardğımız bu tədqiqatla əlaqədar qarşıya belə bir təbii sual çıxa bilər: məqsəd Ala-Tyr-Thr-Tyr-
Val-NH
2
pentapeptid molekulunun fəza quruluşunu, yəni həmin molekula daxil olan atomların fəza
koordinatlarını təyin etmək olduğu halda niyə daxili fırlanma bucaqlarını təyin edirik? Məsələ ondadır
ki, Ala-Tyr-Thr-Tyr-Val-NH
2
pentapeptid molekuluna 100-ə qədər tom daxildir. Bu atomların yekun
koordinatlarınn ümumi sayı 300-ə qədərdir. Kiçiknrjili konformasiyalar sayınn 20 olduğunu da nəzərə
alsaq təyin dəcək koordinatların sayı 60000 olur. Dməli, Ala-Tyr-Thr-Tyr-Val-NH
2
pentapeptid
molekulunun kiçikenrjili konformasiyalarınn fəza quruluşların müəyyən etmək üçün 60000 koordinat
təyin tməliyik. Lakin daxili fıırlanmanııın ikiüzlü bucaqlarından istifadə etdikdə hər konformasiya
üçün cəmi 6 bucaq təyin etmək kifayətdir. Bu daxili fırlanma bucaqlarını təyin etıdikdən sonra məlum