Lecture by Xoshimov Xushbaxt

~2 500 000
последовательностей
DDBJ
EMBL
GenBank
ttttacctctttttagtgatattgtgatatagagcaaaaatcccgacattgtgtcgggattgtttttaaactcttgttgattttaatttttcaatcgcttctttattaaagaagtagtgtgtgccacaacactcacattgcatatcaatacggcctttatgttcggctaatatttcgtcaatttcttcatcagagatgagcagtagatgcagaactagaacgctcagcagagcagccacagaaaaattgtacatcttgtgctggataaagattaacggtttcttcgtgatataaacgataggagtaactcttctgcagggagaccaaataattcttcatcttttactgttgctgcgagcgtagttaaatgctcaaaatcttctggtgtaccagaaccatcaggcataatttgtaataacatacctgctgccactggcttgccttcatattctccagtacgaataattaattgagtttgaagactcatattttcagtgaagtttcgatcgcccttaggaggggccgcgctttctctttcaa
компьютерный поиск гена, трансляция и компьютерная аннотация
UniRef
(UniProt
non-redundant
Reference
databases)
PIR-PSD
UniParc (UniProt Archive)
200 000 последовательностей
Экспертиза
Базы данных
научной литературы

Bioinformatika quyidagi masalalarni hal etishda qo'llaniladi:

• 1. Oqsil va nuklein kislotalarni birlamchidan to uchlamchi strukturalarigacha bo'lgan ma'lumotlarni saqlash va boshqarish;
• 2. Praymerlarni konstruktsiyalarini yaratish;
• 3. Ma'lum bir gen mahsulotlarining vazifasini taxmin qilish;
• 4. Oqsillarning birlamchi strukturasi haqidagi ma'lumotlar asosida ikkilamchi va uchlamchi strukturasini aytib berish va modellashtirish;

Bioinformatika quyidagilarni o'z ichiga oladi:

• Biologik axborotlar saqlanuvchi ma'lumotlar bazalari (GenBank, EMBL, DDBJ, PDB)
• Ushbu bazalarda saqlanayotgan ma'lumotlarni tahlil qilishga imkon beruvchi instrumentlar.
• Biologik vazifalarni to'g'ri hal etish uchun kompyuter metodlaridan to'g'ri foydalanish.

Bioinformatikaning asosiy tadqiqot yo'nalishlari

Bioinformatika quyidagi yo’nalishlarda evolutsion biologlarga yordam beradi:

• Bioinformatika quyidagi yo’nalishlarda evolutsion biologlarga yordam beradi:
• — Ko’pgina organizmlar (tur sonining ahamiyati yo’q) DNK sidagi o’zgarishlarni o’rgangan holda ularni evolutsiya jarayonini o’rganishda;
• — Butun boshli genomlarni solishtirishda (BLAST yordamida); bu esa evolutsion jarayonlarni yaxlit holatda o’rganish imkonini beradi.
• — Populyatsiyalarning kompyuter modelini ishlab chiqishda; bu uzoq vaqt davomida ushbu biologik tizimdagi o’zgarishlar va o’ziga xoslik jarayonini o’rganish imkonini beradi.
• — Juda ko’p turlar haqidagi ma’lumotlarni o’zida jamlagan maqolalarning yaratilishida.

Bioinformatikada qo’llaniladigan eng muhim sohalaridan biri evolutsion biologiyadir. Evolutsion biologiya turlarning kelib chiqishi hamda uzoq vaqt mobaynida qanday shakllanishini tadqiq etadi.