Phylogeny of the Zygomycota based on nuclear ribosomal sequence data

supports the utility of ultrastructural data in chytrid

systematics. Can J Bot 78:336–350.

Jeffries P. 1985. Mycoparasitism within the zygomycetes.

Bot J Linnean Soc 91:135–150.

Jensen AB, Gargas A, Eilenberg J, Rosendahl S. 1998.

Relationships of the insect-pathogenic order Ento-

mophthorales (Zygomycota, Fungi) based on phyloge-

netic analyses of nuclear small subunit ribosomal DNA

sequences (SSU rDNA). Fungal Genet Biol 24:325–334.

Keeling PJ. 2003. Congruent evidence from a-tubulin and b-

tubulin gene phylogenies for a zygomycete origin of

microsporidia. Fungal Genet Biol 38:298–309.

———, Fast NM. 2005. The fungal roots of Microsporidian

parasites. In: Vega FE, Blackwell M, eds. Insect-Fungal

associations ecology and evolution. Oxford: Oxford

Univ. Press. p 97–118.

———, Luker MA, Palmer JD. 2000. Evidence from beta-

tubulin phylogeny that microsporidia evolved from

within the Fungi. Mol Biol Evol 17:23–31.

Keller S. 1997. The genus Neozygites (Zygomycetes,

Entomophthorales) with special reference to species

found in tropical regions. Sydowia 40:118–146.

Kirk PM, Cannon PF, David JC, Stalpers JA. 2001. Ainsworth

and Bisby’s Dictionary of the Fungi. 9th ed. Wall-

ingford, UK: CAB International.

King DS, Humber RA. 1981. Identification of Ento-

mophthorales. In: Burges HD, ed. Microbial control

of pests and plant diseases 1970–1980. London:

Academic Press. p 107–127.

Kurihara Y, Degawa Y, Tokumasu S. 2001. A new genus

Myconymphaea (Kickxellales) with peculiar plugs. My-

col Res 105:1397–1402.

———, ———, ———. 2004. Two novel kickxellalean

fungi, Mycoe¨melia scoparia gen. sp. nov. and Ramican-

delaber brevisporus

sp. nov. Mycol Res 108:1143–1152.

Lichtwardt RW. 1986. The Trichomycetes: fungal associates

of arthropods. New York: Springer-Verlag. 343 p.

———, Manier J-F. 1978. Validation of the Harpellales and

Asellariales. Mycotaxon 7:441–442.

———, Cafaro MJ, White MM. 2001. The Trichomycetes

fungal associates of arthropods. Monograph published

on the internet at http://www.nhm.ku.edu/,fungi.

———, FerringtonJrLC, Lo´pez Lastra C. 1999. Trichomy-

cetes in Argentinean aquatic insect larvae. Mycologia

91:1060–1082.

Lutzoni F, Kauff F, Cox CJ, McLaughlin D, Celio G,

Dentinger B, Padamsee M, Hibbett D, James TY,

Baloch E, Grube M, Reeb V, Hofstetter V, Schoch C,

Arnold AE, Miadlikowska J, Spatafora J, Johnson D,

Hambleton S, Crockett M, Shoemaker R, Sung G-H,

Lu

¨ cking R, Lumbsch T, O’Donnell K, Binder M,

Diederich P, Ertz D, Gueidan C, Hansen K, Harris

RC, Hosaka K, Lim Y-W, Matheny B, Nishida H, Pfister

D, Rogers J, Rossman A, Schmitt I, Sipman H, Stone J,

Sugiyama J, Yahr R, Vilgalys R. 2004. Assembling the

Fungal Tree of Life: progress, classification, and

evolution of subcellular traits. Am J Bot 91:1446–1480.

Maddison D, Maddison W. 2002. MacClade version 4.05:

analysis of phylogeny and character evolution. Sunder-

land, Massachusetts: Sinauer Associates.

McKerracher LJ, Heath IB. 1985. The structure and cycle of

the nucleus-associated organelle in two species of

Basidiobolus. Mycologia 77:412–417.

Mendoza L, Taylor JW, Ajello L. 2002. The class Mesomy-

cetozoea: a heterogenous group of microorganisms at

the animal-fungal boundary. Ann Rev Microbiol 56:

315–44.

Meyer W, Gams W. 2003. Delimitation of Umbelopsis

(Mucorales, Umbelopsidaceae fam. nov.) based on its

ITS sequence and RFLP data. Mycol Res 107:339–350.

Moreau F. 1953. Les champignons. Tome II. Systematique.

Encyc Mycol 23:941–2120.

Morton JB, Benny GL. 1990. Revised classification of

arbuscular mycorrhizal fungi (Zygomycetes): a new

order, Glomales, two new suborders, Glomineae and

Gigasporineae, and two new families, Acaulosporaceae

and Gigasporaceae, with and emendation of Gloma-

ceae. Mycotaxon 37:471–491.

Moss ST. 1979. Commensalism of the Trichomycetes. In:

Batra LR, ed. Insect-fungus symbiosis: nutrition, mutu-

alism, and commensalism. Montclair: Allanheld, Os-

mun & Co. p 175–227.

———. 1998. Harpellales (Trichomycetes); mycobionts of

Insecta. Bot J Scotland 50:137–152.

———, Young TWK. 1978. Phyletic considerations of the

Harpellales and Asellariales (Trichomycetes, Zygomy-

cotina) and the Kickxellales (Zygomycetes, Zygomyco-

tina). Mycologia 70:944–963.

Nagahama T, Sato H, Shimazu M, Sugiyama J. 1995.

Phylogenetic divergence of the entomophthoralean

fungi: evidence from nuclear 18S ribosomal RNA gene

sequences. Mycologia 87:203–209.

Nicholas KB, Nicholas Jr HB. 1997. GeneDoc: analysis and

visualization of genetic variation, http://www.cris.com/

,Ketchup/genedoc.shtml.

Nout MJR, Kiers JL. 2005. Tempe fermentation, innovation

and functionality: update into the third millennium.

J Appl Microbiol 98:789–805.

O’Donnell K. 1979. Zygomycetes in culture. Palfrey Con-

tributions in Botany. No. 2. Athens, Georgia: Depart-

ment of Botany, University of Georgia. 257 p.

———, Cigelnik E, Benny GL. 1998. Phylogenetic relation-

ships among the Harpellales and Kickxellales. Mycolo-

gia 90:624–639.

———, Lutzoni FM, Ward TJ, Benny GL. 2001. Evolutionary

relationships among mucoralean fungi (Zygomycota):

evidence for family polyphyly on a large scale.

Mycologia 93:286–297.

Ogawa Y, Hayashi S, Degawa Y, Yaguchi Y. 2001. Ramican-

delaber, a new genus of the Kickxellales, Zygomycetes.

Mycoscience 42:193–199.

Partida-Martinez LP, Hertweck C. 2005. Pathogenic fungus

harbors endosymbiotic bacteria for toxin production.

Nature 437:884–888.

Posada D, Crandall KA. 1998. Modeltest: testing the model

of DNA substitution. Bioinformatics 14:817–818.

Ragan MA, Goggin CL, Cawthorn RJ, Cerenius L, Jamieson

AVC, Plourde SM, Rand TG, So

¨ derha¨ll K, Gutell RR.

1996. A novel clade of protistan parasites near the

W

HITE ET AL

: P

HYLOGENY OF THE

Z

YGOMYCOTA

883

---